14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1912 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1912  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 304 aa  600  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.699015  normal  0.478041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2071  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.29 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.209894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1319  hypothetical protein  32.11 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194726  hitchhiker  0.00472104 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0406  Tetratricopeptide TPR_4  31.83 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0861646 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1195  hypothetical protein  35.96 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0974487  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1134  hypothetical protein  23.92 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1821  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.103066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2024  hypothetical protein  26.12 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0979  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0547442  normal  0.0871069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 1406 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3810  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 969 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.324215  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 967 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3954  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 970 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1977 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>