80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2338 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  100 
 
 		 1977 aa  3898    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  32.86 
 
 		 3333 aa  337  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.61 
 
 		 4855 aa  293  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  39.84 
 
 		 2035 aa  292  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  32.55 
 
 		 1467 aa  268  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  30.73 
 
 		 1937 aa  249  4.9999999999999997e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.82 
 
 		 2744 aa  213  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11780  hypothetical protein  33.25 
 
 		 660 aa  206  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  30.43 
 
 		 1672 aa  166  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  30.62 
 
 		 1013 aa  166  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  34.06 
 
 		 2716 aa  155  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3373  GLUG domain protein  35.17 
 
 		 578 aa  125  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1064 aa  125  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  24.83 
 
 		 1855 aa  107  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  35.83 
 
 		 1419 aa  106  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0747  GLUG  47.86 
 
 		 454 aa  92.8  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.120548  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  41.12 
 
 		 746 aa  92.4  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.7 
 
 		 1081 aa  88.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.05 
 
 		 759 aa  87.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0211  hypothetical protein  29.17 
 
 		 741 aa  86.3  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  30.64 
 
 		 691 aa  85.9  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.2 
 
 		 1137 aa  82.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.87 
 
 		 808 aa  80.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  29.81 
 
 		 1417 aa  80.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2866  GLUG domain protein  27.8 
 
 		 2267 aa  79.7  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  44.12 
 
 		 2313 aa  75.5  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.29 
 
 		 1148 aa  73.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  27.73 
 
 		 1003 aa  72.8  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1969  GLUG domain protein  26.11 
 
 		 1143 aa  70.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000014348  decreased coverage  0.000000694878 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  36.7 
 
 		 715 aa  68.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2216  hypothetical protein  24.54 
 
 		 576 aa  68.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0273004 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1547  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1181 aa  66.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0222453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  41.25 
 
 		 682 aa  65.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 		 2387 aa  62.4  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  28.4 
 
 		 1009 aa  60.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  42.11 
 
 		 344 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.25 
 
 		 4500 aa  60.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3711  peptidase-like  29.81 
 
 		 232 aa  59.3  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0838  hypothetical protein  41.18 
 
 		 318 aa  58.9  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  42.35 
 
 		 3392 aa  58.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.06 
 
 		 985 aa  58.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  40.96 
 
 		 3242 aa  57.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  42.86 
 
 		 308 aa  57  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.33 
 
 		 607 aa  56.6  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.54 
 
 		 14916 aa  56.6  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  25.77 
 
 		 991 aa  56.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  29.94 
 
 		 1058 aa  56.6  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4281  cell surface protein  32.76 
 
 		 953 aa  56.2  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.533345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  52.31 
 
 		 839 aa  55.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0804  hypothetical protein  30.47 
 
 		 405 aa  55.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000115275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  36.67 
 
 		 319 aa  55.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.02 
 
 		 1004 aa  53.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  40.21 
 
 		 488 aa  53.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1405  spore coat assembly protein-like protein  42.25 
 
 		 709 aa  53.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.430258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  38.67 
 
 		 283 aa  53.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  31.43 
 
 		 248 aa  52.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.06 
 
 		 1637 aa  53.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  32.75 
 
 		 1018 aa  52.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  36.62 
 
 		 653 aa  50.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  40.96 
 
 		 1197 aa  51.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  48.28 
 
 		 303 aa  50.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  27.71 
 
 		 605 aa  50.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3956  SH3 type 3 domain-containing protein  35.87 
 
 		 270 aa  50.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1526  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  30.86 
 
 		 411 aa  48.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597121  normal  0.0174426 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  32 
 
 		 437 aa  48.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  32 
 
 		 439 aa  48.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  48.08 
 
 		 297 aa  47.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  38.96 
 
 		 288 aa  47.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  38.27 
 
 		 322 aa  48.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  29.17 
 
 		 2334 aa  47.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3344  hypothetical protein  34.04 
 
 		 571 aa  47.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00370475  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 657 aa  46.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  40.32 
 
 		 451 aa  46.6  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4807  ftsk/spoiiie family protein  31.58 
 
 		 1284 aa  46.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  40.32 
 
 		 437 aa  46.2  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  35.42 
 
 		 434 aa  46.2  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  27.65 
 
 		 2328 aa  46.2  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  45.95 
 
 		 400 aa  46.2  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5097  hypothetical protein  30.85 
 
 		 537 aa  45.8  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00280261  normal  0.375378 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4823  ftsk/spoiiie family protein  30.99 
 
 		 1270 aa  45.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>