36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3373 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3373  GLUG domain protein  100 
 
 
578 aa  1105    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  35.31 
 
 
1064 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.04 
 
 
4855 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  39.92 
 
 
3333 aa  135  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  35.17 
 
 
1977 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  38.66 
 
 
1467 aa  128  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  39.55 
 
 
1419 aa  121  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  38.54 
 
 
2716 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  38.11 
 
 
1937 aa  116  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.95 
 
 
2744 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0211  hypothetical protein  35.82 
 
 
741 aa  107  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552995  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  28.62 
 
 
1013 aa  94  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  38.01 
 
 
1672 aa  84  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.38 
 
 
808 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  29.45 
 
 
1003 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.7 
 
 
1137 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.09 
 
 
1004 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2866  GLUG domain protein  30.93 
 
 
2267 aa  75.1  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.8 
 
 
1148 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  29.09 
 
 
991 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.45 
 
 
759 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  29.25 
 
 
691 aa  64.3  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  29.36 
 
 
1058 aa  63.9  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  29.29 
 
 
1417 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  27.89 
 
 
1855 aa  60.1  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  29.39 
 
 
2334 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.82 
 
 
1081 aa  57.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0747  GLUG  31.36 
 
 
454 aa  57.4  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.120548  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.25 
 
 
4500 aa  57  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  27.86 
 
 
1009 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  28.13 
 
 
715 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.29 
 
 
1637 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.15 
 
 
985 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  29.33 
 
 
1018 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.73 
 
 
2387 aa  51.2  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1547  hypothetical protein  48.94 
 
 
1181 aa  44.3  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0222453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>