113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3059 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  44.85 
 
 
2334 aa  1297    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  43.4 
 
 
2328 aa  1185    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
2387 aa  4613    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  74.38 
 
 
607 aa  569  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  43.18 
 
 
1058 aa  516  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.57 
 
 
1081 aa  466  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  37.06 
 
 
1419 aa  363  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.27 
 
 
1004 aa  345  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.79 
 
 
985 aa  342  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.04 
 
 
4500 aa  341  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  36.76 
 
 
991 aa  337  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.67 
 
 
1148 aa  336  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  36.91 
 
 
1003 aa  329  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.94 
 
 
800 aa  323  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  45.39 
 
 
770 aa  322  7e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.62 
 
 
1137 aa  320  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  34.05 
 
 
1009 aa  313  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  36.79 
 
 
1018 aa  289  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  41.16 
 
 
2079 aa  288  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.87 
 
 
2744 aa  283  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  47.42 
 
 
390 aa  277  2.0000000000000002e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  44.91 
 
 
1169 aa  265  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  47.88 
 
 
2716 aa  261  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.79 
 
 
4016 aa  260  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  43.42 
 
 
1417 aa  258  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  49.5 
 
 
1105 aa  249  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  38.5 
 
 
1447 aa  240  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.21 
 
 
5613 aa  239  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  38.6 
 
 
1451 aa  238  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.41 
 
 
3589 aa  226  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  47.8 
 
 
1371 aa  221  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  33.96 
 
 
1013 aa  210  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.8 
 
 
3132 aa  207  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  36.32 
 
 
2271 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  36.07 
 
 
1994 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  43.36 
 
 
1999 aa  200  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.69 
 
 
2217 aa  199  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.34 
 
 
2054 aa  196  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  39.94 
 
 
1910 aa  193  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.16 
 
 
759 aa  191  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.81 
 
 
4855 aa  188  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.78 
 
 
808 aa  187  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.23 
 
 
1637 aa  179  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.47 
 
 
2887 aa  178  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  46.69 
 
 
1691 aa  178  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.46 
 
 
481 aa  170  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  29.97 
 
 
715 aa  162  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.31 
 
 
2834 aa  162  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.3 
 
 
956 aa  160  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.41 
 
 
1844 aa  160  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  30.45 
 
 
2679 aa  136  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  39.44 
 
 
1467 aa  114  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  40 
 
 
3349 aa  110  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  31.38 
 
 
1741 aa  108  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  30.2 
 
 
3299 aa  104  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  35.9 
 
 
3332 aa  100  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.36 
 
 
3340 aa  95.9  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  30 
 
 
3409 aa  94  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  35.16 
 
 
4135 aa  93.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  29.88 
 
 
4177 aa  90.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  29.94 
 
 
4184 aa  89.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  36.93 
 
 
1064 aa  89  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  34.09 
 
 
3472 aa  87.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  33.63 
 
 
4009 aa  88.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  34.57 
 
 
4132 aa  86.7  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  34.71 
 
 
4347 aa  85.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  32.22 
 
 
4170 aa  85.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1009  hypothetical protein  57.75 
 
 
122 aa  84.7  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  33.8 
 
 
3333 aa  81.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  31.63 
 
 
4007 aa  80.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  31.96 
 
 
4049 aa  80.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  33.6 
 
 
4030 aa  80.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.53 
 
 
946 aa  77.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  40.79 
 
 
1937 aa  76.3  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  40.7 
 
 
1672 aa  75.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.8 
 
 
4219 aa  75.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  31.79 
 
 
4435 aa  74.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  31.23 
 
 
1855 aa  69.3  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  37.17 
 
 
1672 aa  67.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.61 
 
 
2637 aa  65.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  31.63 
 
 
2296 aa  62.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  30.74 
 
 
1977 aa  61.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  32.58 
 
 
4283 aa  60.1  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0747  GLUG  44.44 
 
 
454 aa  59.3  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.120548  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0837  hemagglutination domain-containing protein  34.53 
 
 
139 aa  57.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0185805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2349  filamentous haemagglutinin-like protein  40.62 
 
 
804 aa  57  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.67 
 
 
1650 aa  57.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.2 
 
 
1772 aa  56.6  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5479  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.09 
 
 
816 aa  56.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3737  filamentous haemagglutinin-like protein  30.9 
 
 
805 aa  54.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1530  conserved hypothetical protein, hemagglutination domain protein  36.59 
 
 
1085 aa  53.9  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.307259  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1279  hypothetical protein  45.45 
 
 
105 aa  53.9  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.66 
 
 
3535 aa  53.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.45 
 
 
3419 aa  53.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0006  filamentous haemagglutinin-like protein  33.33 
 
 
845 aa  52.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2353  filamentous haemagglutinin-like protein  25.62 
 
 
824 aa  52.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1759  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  43.28 
 
 
758 aa  52.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.7 
 
 
3299 aa  51.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.31 
 
 
1570 aa  51.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1755  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.25 
 
 
965 aa  51.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>