122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1078 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  97.61 
 
 		 1937 aa  1174    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  100 
 
 		 1467 aa  2930    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  33.22 
 
 		 3333 aa  308  5.0000000000000004e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  41.95 
 
 		 1821 aa  258  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  33.76 
 
 		 1977 aa  252  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.61 
 
 		 4855 aa  199  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  40 
 
 		 1672 aa  184  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  38.52 
 
 		 2716 aa  178  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  40 
 
 		 1013 aa  171  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1073  hypothetical protein  93.42 
 
 		 84 aa  148  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.680757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.48 
 
 		 2744 aa  143  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  37.22 
 
 		 1064 aa  140  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  42.38 
 
 		 1419 aa  139  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  45.14 
 
 		 1009 aa  126  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.31 
 
 		 759 aa  123  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3373  GLUG domain protein  36.63 
 
 		 578 aa  116  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  42.05 
 
 		 437 aa  111  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.65 
 
 		 1081 aa  110  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.81 
 
 		 1637 aa  108  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  37.81 
 
 		 691 aa  103  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0211  hypothetical protein  31.67 
 
 		 741 aa  103  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552995  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  37.5 
 
 		 981 aa  101  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  33.05 
 
 		 1009 aa  100  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2866  GLUG domain protein  35.25 
 
 		 2267 aa  99.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.82 
 
 		 1148 aa  98.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  41.24 
 
 		 715 aa  97.1  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.09 
 
 		 1004 aa  96.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  36.28 
 
 		 1300 aa  95.1  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0747  GLUG  36.96 
 
 		 454 aa  94.7  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.120548  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  34.74 
 
 		 1058 aa  94.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  30.49 
 
 		 991 aa  92.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.8 
 
 		 2387 aa  92  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.15 
 
 		 808 aa  91.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  33.67 
 
 		 4630 aa  90.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  40.24 
 
 		 1048 aa  87.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  34.96 
 
 		 1417 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  38.69 
 
 		 570 aa  86.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  49.24 
 
 		 1003 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.55 
 
 		 1137 aa  81.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.05 
 
 		 4500 aa  80.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  28.78 
 
 		 1018 aa  79.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  56.79 
 
 		 526 aa  76.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  31.71 
 
 		 2328 aa  75.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  31.2 
 
 		 2334 aa  73.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  48.75 
 
 		 556 aa  72.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  33.13 
 
 		 1831 aa  72  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1547  hypothetical protein  34.42 
 
 		 1181 aa  70.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0222453  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.09 
 
 		 985 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  35.29 
 
 		 220 aa  70.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  32.39 
 
 		 390 aa  68.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  32.45 
 
 		 2638 aa  67.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  44.32 
 
 		 1756 aa  66.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  30.33 
 
 		 1855 aa  65.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  34.05 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  40.54 
 
 		 428 aa  64.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  30.99 
 
 		 1279 aa  64.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  41.89 
 
 		 1081 aa  63.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  35.66 
 
 		 462 aa  61.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  37.35 
 
 		 576 aa  60.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  30.63 
 
 		 472 aa  60.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1969  GLUG domain protein  25.96 
 
 		 1143 aa  60.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000014348  decreased coverage  0.000000694878 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0456  hypothetical protein  34.38 
 
 		 2764 aa  59.3  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000000873422 
 
 
-
 
NC_002950  PG2216  hypothetical protein  26.87 
 
 		 576 aa  58.9  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0273004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.74 
 
 		 639 aa  58.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  34.65 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  51.56 
 
 		 554 aa  57.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2341  agarase  39.8 
 
 		 1171 aa  57.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  47.06 
 
 		 306 aa  57  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  37.93 
 
 		 1421 aa  56.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  40 
 
 		 1030 aa  56.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0839  Ig-like, group 2  26.77 
 
 		 983 aa  55.5  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  41.1 
 
 		 848 aa  55.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  33.54 
 
 		 730 aa  55.5  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  43.37 
 
 		 1418 aa  55.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.33 
 
 		 607 aa  55.5  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  25.5 
 
 		 1361 aa  54.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1044  hypothetical protein  32.05 
 
 		 604 aa  54.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0661829 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  33.04 
 
 		 1732 aa  53.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  42.68 
 
 		 1193 aa  53.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  41.76 
 
 		 1965 aa  54.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 1077 aa  54.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.85 
 
 		 2156 aa  54.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0169  hypothetical protein  37.62 
 
 		 629 aa  53.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  33.61 
 
 		 316 aa  53.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  29.14 
 
 		 799 aa  52.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  33.08 
 
 		 892 aa  52.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  43.9 
 
 		 1226 aa  52.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  38.82 
 
 		 599 aa  52.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2588  hypothetical protein  35.66 
 
 		 195 aa  52  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  36.67 
 
 		 715 aa  52  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  41.89 
 
 		 788 aa  52  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.24 
 
 		 788 aa  51.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  41.77 
 
 		 652 aa  51.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  32.03 
 
 		 399 aa  50.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  43.24 
 
 		 788 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3264  Ig domain-containing protein  40 
 
 		 262 aa  50.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32 
 
 		 788 aa  50.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  41.89 
 
 		 788 aa  50.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0838  hypothetical protein  34.43 
 
 		 318 aa  50.1  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  42.86 
 
 		 758 aa  49.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>