35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1889 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 331 aa  659    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  36.44 
 
 		 1821 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  30.82 
 
 		 1300 aa  96.7  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  26.6 
 
 		 1279 aa  83.6  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  29.88 
 
 		 4630 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  30.48 
 
 		 2042 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  31.15 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  32.08 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  25.78 
 
 		 1361 aa  70.5  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  42.98 
 
 		 730 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  28.99 
 
 		 570 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  31.19 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2588  hypothetical protein  36.91 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  34.57 
 
 		 1467 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  34.57 
 
 		 1937 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  37.58 
 
 		 981 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.49 
 
 		 752 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  37.5 
 
 		 466 aa  52.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  29.56 
 
 		 1009 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  45.12 
 
 		 1048 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  24.41 
 
 		 1316 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  26.67 
 
 		 892 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  30.3 
 
 		 2457 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  31.62 
 
 		 462 aa  46.2  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3264  Ig domain-containing protein  26.67 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  25.29 
 
 		 575 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 		 1077 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3430  Ig domain-containing protein  33.65 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  32.35 
 
 		 2638 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  38.96 
 
 		 526 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0362  Ig-like domain-containing protein  28.19 
 
 		 647 aa  43.5  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  43.75 
 
 		 428 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  37.7 
 
 		 2122 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  33.98 
 
 		 1409 aa  42.4  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  26.49 
 
 		 1831 aa  42.4  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>