13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0362 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0362  Ig-like domain-containing protein  100 
 
 
647 aa  1332    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318383  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  28.07 
 
 
981 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  29.89 
 
 
4630 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  26.92 
 
 
437 aa  54.7  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  30.43 
 
 
942 aa  51.2  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  29.33 
 
 
1421 aa  50.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  26.92 
 
 
1821 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
1077 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  38.24 
 
 
1048 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  26.97 
 
 
1300 aa  48.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0886  Ig-like, group 2  32.97 
 
 
582 aa  48.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.226822  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1068  Ig domain-containing protein  33.71 
 
 
151 aa  43.9  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.383445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1088  Ig domain-containing protein  33.71 
 
 
151 aa  43.9  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.704248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>