33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2596 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 390 aa  758    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  33.17 
 
 		 466 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  33.15 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  30.27 
 
 		 1009 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  31.14 
 
 		 1821 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  37.59 
 
 		 1300 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  27.98 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  32.5 
 
 		 4630 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  32.3 
 
 		 220 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  28.1 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  29.56 
 
 		 981 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  31.1 
 
 		 570 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  26.32 
 
 		 1279 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  30.87 
 
 		 1831 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  26.63 
 
 		 1048 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.88 
 
 		 752 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.05 
 
 		 1776 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  40.24 
 
 		 730 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  32.14 
 
 		 1937 aa  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  32.14 
 
 		 1467 aa  49.7  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  28.09 
 
 		 576 aa  49.7  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  29.29 
 
 		 556 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  28.23 
 
 		 472 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3475  Ig domain-containing protein  28.04 
 
 		 842 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000102294  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  25.28 
 
 		 892 aa  47.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  28.89 
 
 		 799 aa  47.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  29.66 
 
 		 1965 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  32.88 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  36.07 
 
 		 1732 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  30.86 
 
 		 526 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  33.04 
 
 		 600 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  31.65 
 
 		 1193 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3064  hypothetical protein  31.94 
 
 		 218 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>