17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3475 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3475  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 842 aa  1680    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000102294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  30.11 
 
 		 399 aa  60.1  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3510  Ig domain-containing protein  31.73 
 
 		 811 aa  58.5  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000494417  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  31.52 
 
 		 1300 aa  57.8  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  34.59 
 
 		 4630 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  34.93 
 
 		 437 aa  55.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  29.52 
 
 		 390 aa  52  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  37.5 
 
 		 1009 aa  52  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  36.09 
 
 		 981 aa  51.6  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  37.7 
 
 		 1937 aa  50.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3430  Ig domain-containing protein  45.59 
 
 		 241 aa  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0205063  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  31.43 
 
 		 220 aa  50.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  37.7 
 
 		 1467 aa  50.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0974  S-layer protein  27.48 
 
 		 819 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000842335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  42.11 
 
 		 691 aa  48.5  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  50 
 
 		 1048 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  29.08 
 
 		 1821 aa  46.2  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>