75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2672 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 1193 aa  2404    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  46.86 
 
 		 2706 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  38.21 
 
 		 3802 aa  458  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  61.17 
 
 		 693 aa  408  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  60.49 
 
 		 970 aa  408  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  43.36 
 
 		 1069 aa  200  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  49.78 
 
 		 601 aa  191  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  33.56 
 
 		 1762 aa  183  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  57.5 
 
 		 812 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1231  NHL repeat-containing protein  31.67 
 
 		 1049 aa  145  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.001634  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  45.86 
 
 		 693 aa  133  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  45.86 
 
 		 1392 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  50 
 
 		 1424 aa  127  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  47.3 
 
 		 1236 aa  124  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  45.33 
 
 		 1295 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  44.29 
 
 		 1206 aa  118  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  42.01 
 
 		 516 aa  106  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  40.12 
 
 		 1193 aa  100  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  37.58 
 
 		 1687 aa  88.6  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  34.15 
 
 		 1465 aa  87.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  43.97 
 
 		 2142 aa  87  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  26.72 
 
 		 1656 aa  83.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4492  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1853 aa  83.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.664727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4124  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1853 aa  83.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.888798 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  32.82 
 
 		 1479 aa  83.2  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  29.5 
 
 		 2170 aa  82.4  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4606  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1574 aa  79.7  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  47.62 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  30.63 
 
 		 1108 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  41.74 
 
 		 850 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1808  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  32.43 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145973  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1842  hyaluronoglucosaminidase domain-containing protein  35.85 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  31.72 
 
 		 677 aa  68.2  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  34.53 
 
 		 658 aa  66.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  42.39 
 
 		 981 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  38.18 
 
 		 1455 aa  63.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  46.91 
 
 		 526 aa  60.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  44.19 
 
 		 1201 aa  58.9  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  43.82 
 
 		 1732 aa  58.9  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  50 
 
 		 1048 aa  57.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3370  Ig domain-containing protein  45.78 
 
 		 389 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  33.93 
 
 		 4630 aa  57.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  37.38 
 
 		 437 aa  55.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  40.43 
 
 		 1937 aa  55.5  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  40.43 
 
 		 1467 aa  55.5  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  36.52 
 
 		 1300 aa  54.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  45.12 
 
 		 688 aa  54.3  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0480  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  37.61 
 
 		 794 aa  54.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.133222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.11 
 
 		 1200 aa  53.5  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  34.58 
 
 		 1361 aa  52.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  38.55 
 
 		 2122 aa  51.6  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2846  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  31.78 
 
 		 624 aa  51.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  32.04 
 
 		 472 aa  51.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1438  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  37.93 
 
 		 639 aa  51.2  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  33.65 
 
 		 472 aa  49.7  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  42.19 
 
 		 428 aa  50.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  33.6 
 
 		 1732 aa  49.3  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  39.13 
 
 		 1077 aa  48.9  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  28.44 
 
 		 419 aa  48.5  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3264  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 		 262 aa  48.5  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  35.51 
 
 		 631 aa  47.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  31.63 
 
 		 1119 aa  48.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  36.14 
 
 		 1279 aa  47.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  39.39 
 
 		 1115 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  41.89 
 
 		 220 aa  47  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2662  Ig domain protein group 2 domain protein  41.59 
 
 		 332 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10701  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  34.43 
 
 		 338 aa  47.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2757  Ig domain protein group 2 domain protein  39.82 
 
 		 332 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  33.04 
 
 		 1821 aa  46.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  33.03 
 
 		 1009 aa  46.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  27.24 
 
 		 342 aa  45.8  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  40.23 
 
 		 310 aa  45.8  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  32.93 
 
 		 1965 aa  45.8  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  32.59 
 
 		 316 aa  45.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2868  PKD domain containing protein  37.5 
 
 		 687 aa  44.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>