21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4124 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4492  hypothetical protein  99.46 
 
 		 1853 aa  3622    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.664727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4606  hypothetical protein  83.52 
 
 		 1574 aa  2483    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4124  hypothetical protein  100 
 
 		 1853 aa  3637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.888798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  40.05 
 
 		 2170 aa  419  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  37.63 
 
 		 1656 aa  407  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  81.4 
 
 		 503 aa  275  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  81.76 
 
 		 503 aa  273  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1231  NHL repeat-containing protein  28.79 
 
 		 1049 aa  197  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.001634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  30.58 
 
 		 2706 aa  97.8  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  38.85 
 
 		 933 aa  89  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  28.65 
 
 		 1762 aa  87.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  27.37 
 
 		 1193 aa  84  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2792  hypothetical protein  40.37 
 
 		 938 aa  75.9  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  35.33 
 
 		 1461 aa  71.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  35.06 
 
 		 524 aa  70.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  29.51 
 
 		 970 aa  67.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  30.58 
 
 		 3802 aa  66.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  33.85 
 
 		 662 aa  56.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1170 aa  51.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.38 
 
 		 1501 aa  49.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  28.34 
 
 		 1171 aa  48.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>