79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2666 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  94.29 
 
 
693 aa  715    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 
970 aa  1964    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  59.84 
 
 
1193 aa  417  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  43.36 
 
 
1069 aa  213  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  38.87 
 
 
2706 aa  213  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  62.96 
 
 
601 aa  206  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  60 
 
 
812 aa  187  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  45.16 
 
 
1206 aa  141  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  46.62 
 
 
1392 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  48.98 
 
 
693 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  40.96 
 
 
1236 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  47.26 
 
 
1424 aa  133  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  42.48 
 
 
1295 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  30.72 
 
 
3802 aa  102  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  38.67 
 
 
2142 aa  100  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  38.26 
 
 
1479 aa  98.6  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  36.61 
 
 
1465 aa  94  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  39.6 
 
 
1687 aa  93.2  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  34.64 
 
 
1193 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  35.67 
 
 
2170 aa  89.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  36.99 
 
 
1762 aa  87  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  38.71 
 
 
850 aa  85.5  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  37.36 
 
 
662 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  31.76 
 
 
933 aa  77.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  31.06 
 
 
658 aa  75.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  32.24 
 
 
677 aa  75.5  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2792  hypothetical protein  37.68 
 
 
938 aa  74.7  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  34.23 
 
 
1108 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.26 
 
 
1201 aa  68.9  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4492  hypothetical protein  29.51 
 
 
1853 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.664727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4124  hypothetical protein  29.51 
 
 
1853 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.888798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  40.62 
 
 
631 aa  67.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  48.48 
 
 
1401 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  30.13 
 
 
1455 aa  66.6  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4606  hypothetical protein  32.02 
 
 
1574 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1842  hyaluronoglucosaminidase domain-containing protein  33.01 
 
 
248 aa  65.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  30.23 
 
 
1170 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  32.07 
 
 
503 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  32.22 
 
 
503 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1231  NHL repeat-containing protein  30.51 
 
 
1049 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.001634  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1808  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  27.93 
 
 
413 aa  63.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  45.45 
 
 
1401 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  33.54 
 
 
1667 aa  60.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  32 
 
 
1461 aa  60.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  31.48 
 
 
524 aa  58.9  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  34.58 
 
 
1307 aa  58.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 
1175 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 
469 aa  55.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  29.41 
 
 
1171 aa  55.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  33.64 
 
 
1119 aa  54.3  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2846  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  33.64 
 
 
624 aa  53.5  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.07 
 
 
1501 aa  53.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  38.14 
 
 
1847 aa  52.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2773  Fibronectin type III domain protein  36.36 
 
 
690 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000670095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  32.41 
 
 
636 aa  51.6  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.01 
 
 
6885 aa  51.6  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  32.43 
 
 
1199 aa  51.6  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2229  hypothetical protein  31.03 
 
 
1018 aa  51.2  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.394559  normal  0.0986595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  38.89 
 
 
1462 aa  51.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0196  fibronectin, type III  31.97 
 
 
354 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  35.24 
 
 
767 aa  49.7  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1438  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  38.71 
 
 
639 aa  49.3  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  34.29 
 
 
741 aa  48.9  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  30 
 
 
733 aa  48.5  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  33.71 
 
 
2927 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  26.85 
 
 
1222 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  35.4 
 
 
5743 aa  47.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1446  fibronectin, type III domain-containing protein  32 
 
 
1089 aa  47.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  38.55 
 
 
1115 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  36.78 
 
 
1172 aa  46.6  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  35.63 
 
 
410 aa  46.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 
1137 aa  46.2  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 
1121 aa  46.2  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  29.7 
 
 
1242 aa  45.8  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 
1209 aa  45.8  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  32.45 
 
 
703 aa  45.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3437  fibronectin type III domain-containing protein  31.91 
 
 
1135 aa  45.4  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230863  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  29.71 
 
 
997 aa  44.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
1230 aa  44.3  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>