More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0358 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 503 aa  976    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  96.22 
 
 		 503 aa  941    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  78.08 
 
 		 462 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  53.22 
 
 		 448 aa  344  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4606  hypothetical protein  81.07 
 
 		 1574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4492  hypothetical protein  81.4 
 
 		 1853 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.664727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4124  hypothetical protein  81.4 
 
 		 1853 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.888798 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.78 
 
 		 1029 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  38.78 
 
 		 1029 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  43.64 
 
 		 2954 aa  163  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  37.18 
 
 		 3209 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  46.88 
 
 		 3608 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.29 
 
 		 1415 aa  156  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  35.59 
 
 		 2198 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  45.24 
 
 		 768 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  36.01 
 
 		 395 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  36.01 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  37.84 
 
 		 2133 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  40.64 
 
 		 907 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  44.53 
 
 		 2807 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  38.67 
 
 		 3954 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  41.48 
 
 		 851 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  41.54 
 
 		 1764 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  47.27 
 
 		 3619 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  36.02 
 
 		 1019 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  46.88 
 
 		 3619 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  41.13 
 
 		 1855 aa  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  46.37 
 
 		 4334 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  39.69 
 
 		 2467 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  34.94 
 
 		 824 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  43.48 
 
 		 1532 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  33.78 
 
 		 1133 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  41.55 
 
 		 1534 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  38.37 
 
 		 727 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  37.63 
 
 		 1197 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  44.39 
 
 		 1610 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  38.86 
 
 		 467 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  39.27 
 
 		 3026 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  39 
 
 		 1134 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.7 
 
 		 1180 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  43.13 
 
 		 1610 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  31.16 
 
 		 2701 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  32.61 
 
 		 574 aa  107  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  35.25 
 
 		 1582 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 475 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  38.17 
 
 		 820 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  32.14 
 
 		 1839 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  38.18 
 
 		 475 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  33.85 
 
 		 2567 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  38.61 
 
 		 2950 aa  103  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.3 
 
 		 588 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  35.29 
 
 		 546 aa  100  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  37.67 
 
 		 1557 aa  99.8  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  33.1 
 
 		 1037 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  36.71 
 
 		 2105 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  35.99 
 
 		 2097 aa  96.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  31.2 
 
 		 1403 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.05 
 
 		 2667 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  33.53 
 
 		 745 aa  94.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  34.36 
 
 		 2911 aa  93.2  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  36.73 
 
 		 946 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  34.24 
 
 		 4687 aa  90.5  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  30.11 
 
 		 856 aa  90.1  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.77 
 
 		 2678 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  32.66 
 
 		 1079 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  31.2 
 
 		 998 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  31.58 
 
 		 858 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  34.53 
 
 		 648 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  38.67 
 
 		 1213 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  35.51 
 
 		 942 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  31.66 
 
 		 1072 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  31.46 
 
 		 998 aa  87.8  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  31.11 
 
 		 795 aa  87.8  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  32.52 
 
 		 1168 aa  87.4  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  40 
 
 		 614 aa  87.8  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  33.94 
 
 		 329 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  31.91 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  33.94 
 
 		 329 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  26.97 
 
 		 1055 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  33.23 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  33.65 
 
 		 2775 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  33.88 
 
 		 526 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  32.84 
 
 		 889 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.1 
 
 		 1795 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  32.14 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  31.68 
 
 		 1287 aa  81.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  34.36 
 
 		 855 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  28.65 
 
 		 813 aa  80.5  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  32.79 
 
 		 1164 aa  80.1  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  33.23 
 
 		 1480 aa  80.1  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  31.7 
 
 		 531 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  35.34 
 
 		 1145 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  31.75 
 
 		 486 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  31.43 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  35.95 
 
 		 933 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  37.55 
 
 		 1279 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  32.52 
 
 		 4798 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  31 
 
 		 623 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  29.96 
 
 		 901 aa  77.8  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  33.45 
 
 		 1895 aa  76.6  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>