More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1355 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
623 aa  1169    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  35.01 
 
 
1400 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  34.66 
 
 
946 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  35.51 
 
 
4334 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  35.13 
 
 
965 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  30.18 
 
 
2954 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.93 
 
 
1279 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  35.19 
 
 
1363 aa  127  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  33.45 
 
 
4800 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  33.66 
 
 
2689 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  31.82 
 
 
518 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  32.71 
 
 
1534 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  31.38 
 
 
2105 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.7 
 
 
1795 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  33.61 
 
 
595 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  29.44 
 
 
1499 aa  107  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  29.92 
 
 
9867 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  35.33 
 
 
3954 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  30.38 
 
 
1156 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  38.59 
 
 
491 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  29.52 
 
 
556 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.1 
 
 
2667 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  37.7 
 
 
1287 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  32.94 
 
 
1532 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  34.38 
 
 
613 aa  98.6  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  32.9 
 
 
1079 aa  98.2  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  31.24 
 
 
1145 aa  97.8  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.88 
 
 
3427 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  34.55 
 
 
2836 aa  96.3  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  30.55 
 
 
1544 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.6 
 
 
2678 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  34.77 
 
 
393 aa  94.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  31.22 
 
 
1855 aa  94  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  32.59 
 
 
2911 aa  93.2  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  34.75 
 
 
4687 aa  92.8  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.14 
 
 
980 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  34.38 
 
 
526 aa  92  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  31.65 
 
 
824 aa  90.5  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  29.42 
 
 
1884 aa  90.5  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  31.78 
 
 
1164 aa  89  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  32.63 
 
 
1424 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  32.43 
 
 
813 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  30.41 
 
 
860 aa  88.2  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  33.43 
 
 
833 aa  87.8  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  31.74 
 
 
2145 aa  87.4  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  27.46 
 
 
589 aa  87  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  29.04 
 
 
682 aa  87  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  27.97 
 
 
855 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  31.62 
 
 
3209 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  32.7 
 
 
341 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1287  VCBS  33.43 
 
 
610 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.535504  normal  0.448224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.57 
 
 
2668 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.05 
 
 
2775 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  33.08 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.76 
 
 
588 aa  84  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  31.79 
 
 
795 aa  83.2  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  30.6 
 
 
1895 aa  83.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  32.96 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  32.59 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  32.67 
 
 
982 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  29.91 
 
 
516 aa  82.4  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  34 
 
 
1883 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.82 
 
 
1236 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  39.13 
 
 
736 aa  80.9  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  31.5 
 
 
503 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.35 
 
 
421 aa  79.7  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  28.98 
 
 
820 aa  78.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 
589 aa  78.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
1043 aa  78.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  30.6 
 
 
1582 aa  77.8  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  31 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  34.2 
 
 
942 aa  78.2  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  38.31 
 
 
245 aa  77  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  31.03 
 
 
3608 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  28.64 
 
 
769 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  31.75 
 
 
3619 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  36.2 
 
 
1712 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  33.44 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  28.57 
 
 
4798 aa  74.3  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  30.79 
 
 
742 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.25 
 
 
1884 aa  73.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  32.84 
 
 
3619 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  31.03 
 
 
460 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  32.93 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  31.73 
 
 
959 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  30.33 
 
 
2245 aa  72  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  32.14 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3277  hemolysin-type calcium-binding region  31.75 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.477972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  31.01 
 
 
1421 aa  71.2  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  34.75 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  30.58 
 
 
728 aa  70.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  29.74 
 
 
745 aa  70.9  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  30.67 
 
 
1029 aa  70.5  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  30.73 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.67 
 
 
1029 aa  70.5  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  32.34 
 
 
729 aa  70.5  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  30.12 
 
 
437 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 
467 aa  70.5  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  34.05 
 
 
709 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  29.56 
 
 
1197 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>