More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0263 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  69.55 
 
 
729 aa  988    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  100 
 
 
742 aa  1470    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  47.63 
 
 
680 aa  574  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  40.64 
 
 
736 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  40.5 
 
 
724 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  39.35 
 
 
728 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  37.8 
 
 
739 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  36.83 
 
 
717 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 
639 aa  302  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  43.09 
 
 
572 aa  257  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4310  Hemolysin-type calcium-binding region  40.4 
 
 
620 aa  251  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.62 
 
 
1279 aa  130  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  32.58 
 
 
2954 aa  125  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  46.55 
 
 
950 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
946 aa  121  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  38.68 
 
 
1400 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  36.89 
 
 
2105 aa  119  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.51 
 
 
980 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  36.08 
 
 
1363 aa  117  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.29 
 
 
3427 aa  117  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  34.62 
 
 
2667 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  37.21 
 
 
595 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  31.05 
 
 
1164 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  32.13 
 
 
1424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  36.32 
 
 
795 aa  110  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.69 
 
 
1795 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  42.94 
 
 
4334 aa  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  35.15 
 
 
424 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  34.34 
 
 
1534 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  37.39 
 
 
460 aa  108  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  38.49 
 
 
1895 aa  108  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.52 
 
 
1963 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  33.94 
 
 
2689 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  42.07 
 
 
257 aa  105  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  32.21 
 
 
2145 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  39.45 
 
 
1287 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  36.91 
 
 
491 aa  104  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  43.12 
 
 
585 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.49 
 
 
588 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  43.12 
 
 
679 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.03 
 
 
2668 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.44 
 
 
1016 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  31.52 
 
 
526 aa  101  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  41.21 
 
 
686 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  35.29 
 
 
833 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  35.37 
 
 
3608 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  42.5 
 
 
582 aa  99.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  42.76 
 
 
243 aa  99  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  35.42 
 
 
3619 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 
245 aa  98.6  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  33.45 
 
 
613 aa  98.6  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 
709 aa  98.2  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  43.7 
 
 
615 aa  97.8  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  47.62 
 
 
867 aa  97.8  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
9867 aa  97.8  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  42.86 
 
 
280 aa  97.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  36.02 
 
 
3954 aa  97.4  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  35.34 
 
 
3619 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  42.14 
 
 
280 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  41.06 
 
 
938 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  37.3 
 
 
982 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  39.64 
 
 
385 aa  95.5  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  42.65 
 
 
355 aa  95.9  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  42.03 
 
 
1175 aa  95.9  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  34.71 
 
 
965 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  43.31 
 
 
4798 aa  95.1  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  41.67 
 
 
813 aa  94.4  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  43.75 
 
 
2885 aa  94.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
589 aa  94.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  37.64 
 
 
833 aa  94  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  40.71 
 
 
686 aa  94  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  35.21 
 
 
5171 aa  94  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  44.88 
 
 
260 aa  94  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  37.2 
 
 
361 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  34.35 
 
 
850 aa  93.6  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  32.12 
 
 
14829 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  32.11 
 
 
387 aa  92.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  34.29 
 
 
741 aa  92  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  32.06 
 
 
1532 aa  91.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  39.87 
 
 
606 aa  91.3  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  42.38 
 
 
219 aa  91.3  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36 
 
 
421 aa  91.3  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
1236 aa  91.3  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  37.04 
 
 
744 aa  91.3  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  32.33 
 
 
734 aa  91.3  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  38.22 
 
 
1544 aa  90.9  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  44.06 
 
 
219 aa  90.1  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  36.23 
 
 
361 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  34.5 
 
 
341 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  36.94 
 
 
460 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  35.81 
 
 
361 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  38.26 
 
 
357 aa  89  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  45.67 
 
 
396 aa  89  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  38.2 
 
 
1043 aa  89  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  54.46 
 
 
518 aa  88.6  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  35.66 
 
 
757 aa  88.6  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  37.5 
 
 
1156 aa  88.2  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  35.34 
 
 
341 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.79 
 
 
2678 aa  88.2  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  44.14 
 
 
1526 aa  87.8  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>