More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6438 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  59.97 
 
 		 724 aa  756    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  100 
 
 		 680 aa  1345    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  47.63 
 
 		 742 aa  574  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  46.57 
 
 		 729 aa  528  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  43.04 
 
 		 639 aa  422  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  40.39 
 
 		 572 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  34.19 
 
 		 717 aa  297  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  36.7 
 
 		 736 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4310  Hemolysin-type calcium-binding region  39.72 
 
 		 620 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  30.05 
 
 		 728 aa  227  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  29.36 
 
 		 739 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.56 
 
 		 1279 aa  117  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  32.18 
 
 		 1534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  36.86 
 
 		 2954 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.4 
 
 		 3427 aa  115  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  35.83 
 
 		 950 aa  114  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  36.43 
 
 		 1363 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  40.41 
 
 		 1164 aa  110  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  34.64 
 
 		 833 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  34.85 
 
 		 2145 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.82 
 
 		 946 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  37 
 
 		 595 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  38.4 
 
 		 2105 aa  108  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.16 
 
 		 980 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  35.42 
 
 		 4334 aa  106  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  43.64 
 
 		 1424 aa  105  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.97 
 
 		 2668 aa  103  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.32 
 
 		 1795 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  35.22 
 
 		 613 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  35.91 
 
 		 460 aa  103  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.62 
 
 		 1963 aa  99.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  39.47 
 
 		 1400 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 709 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  45.19 
 
 		 813 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  39.33 
 
 		 1287 aa  97.8  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  39.44 
 
 		 2689 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  32.82 
 
 		 2667 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 		 260 aa  96.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 		 491 aa  96.3  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  36.22 
 
 		 938 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 5171 aa  95.5  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  43.04 
 
 		 679 aa  95.5  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  31.23 
 
 		 606 aa  94.7  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  36.87 
 
 		 280 aa  94.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  40.94 
 
 		 4687 aa  94  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  35.38 
 
 		 1895 aa  94  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  44.6 
 
 		 3954 aa  93.6  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.27 
 
 		 588 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  41.4 
 
 		 219 aa  93.6  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 		 1532 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  44.96 
 
 		 2885 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  41.03 
 
 		 824 aa  92.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  42.68 
 
 		 585 aa  92.4  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  43.33 
 
 		 9867 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 		 589 aa  92  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  36.36 
 
 		 280 aa  92.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  39.44 
 
 		 257 aa  92  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 341 aa  92  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  34.98 
 
 		 526 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  33.46 
 
 		 982 aa  90.9  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  35.86 
 
 		 850 aa  89.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  40.68 
 
 		 744 aa  90.1  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  37.28 
 
 		 357 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  36.18 
 
 		 4800 aa  89.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  42.24 
 
 		 243 aa  89.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.5 
 
 		 1236 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  38.89 
 
 		 757 aa  89.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  39.35 
 
 		 219 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  35.98 
 
 		 734 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  36.17 
 
 		 795 aa  89.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  42.04 
 
 		 582 aa  89.7  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0639  hypothetical protein  37.57 
 
 		 468 aa  88.6  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.77 
 
 		 1016 aa  89  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  37.43 
 
 		 385 aa  88.6  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  39.23 
 
 		 867 aa  89  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  42.75 
 
 		 327 aa  89  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  33 
 
 		 4798 aa  88.6  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  34.75 
 
 		 387 aa  88.6  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 303 aa  88.2  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  40.84 
 
 		 341 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  38.61 
 
 		 686 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  36.78 
 
 		 424 aa  87.4  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.53 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  36.6 
 
 		 561 aa  85.9  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  44.37 
 
 		 1197 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  40.14 
 
 		 3619 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  40.25 
 
 		 686 aa  85.1  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  40.14 
 
 		 3619 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  34.73 
 
 		 525 aa  84.7  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  37.13 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  40.53 
 
 		 1043 aa  84  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  34.13 
 
 		 1499 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 		 361 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  39.26 
 
 		 615 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  45.31 
 
 		 355 aa  83.2  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.5 
 
 		 2678 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  35.5 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  41.14 
 
 		 518 aa  82.4  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  31.89 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  28.23 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>