More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7343 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
615 aa  1224    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  57.1 
 
 
341 aa  317  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  58.59 
 
 
980 aa  317  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  73.76 
 
 
686 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  66.3 
 
 
341 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  58.25 
 
 
460 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54.91 
 
 
2668 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  58.59 
 
 
460 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  51.95 
 
 
526 aa  259  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  49.59 
 
 
363 aa  257  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.82 
 
 
1795 aa  250  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  53.79 
 
 
2105 aa  247  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.57 
 
 
1016 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  38.33 
 
 
2667 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.94 
 
 
1236 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  42.46 
 
 
1712 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  41.44 
 
 
2775 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  48.98 
 
 
2885 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.62 
 
 
3427 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  43.66 
 
 
946 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  46.02 
 
 
1279 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  45.87 
 
 
3619 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  43.97 
 
 
2954 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  46.47 
 
 
3619 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  41.32 
 
 
613 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  43.67 
 
 
1287 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  44.31 
 
 
260 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  47.44 
 
 
1424 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  39.3 
 
 
1164 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  35.6 
 
 
393 aa  147  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  46.54 
 
 
491 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  37.42 
 
 
1534 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  40.68 
 
 
9867 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  36.54 
 
 
1532 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  42.04 
 
 
595 aa  144  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  37.42 
 
 
2145 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  39.22 
 
 
982 aa  140  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  42.63 
 
 
1363 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
1895 aa  139  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  34.76 
 
 
1499 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  42.8 
 
 
757 aa  137  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  40.48 
 
 
3954 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46 
 
 
588 aa  134  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  42.92 
 
 
1400 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  45.53 
 
 
3608 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  36.79 
 
 
833 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  44.87 
 
 
1855 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  39.68 
 
 
813 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  37.68 
 
 
387 aa  130  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  30.75 
 
 
1156 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  44.98 
 
 
4334 aa  128  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  43.6 
 
 
219 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  43.41 
 
 
202 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  43.41 
 
 
202 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  38.46 
 
 
2689 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  42.59 
 
 
5171 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 
965 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.04 
 
 
2678 aa  124  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  38.17 
 
 
709 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  35.92 
 
 
820 aa  120  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  36.67 
 
 
850 aa  120  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  31.9 
 
 
1079 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  39.04 
 
 
467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  35.53 
 
 
424 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 
4687 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  42.65 
 
 
219 aa  117  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  38.71 
 
 
606 aa  117  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  40.81 
 
 
437 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.05 
 
 
1963 aa  116  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  39.78 
 
 
589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1816  hemolysin-type calcium-binding region  37.36 
 
 
273 aa  115  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000360233  n/a   
 
 
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  36.21 
 
 
1544 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  43.13 
 
 
280 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  41 
 
 
361 aa  115  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  41 
 
 
361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  37.85 
 
 
387 aa  114  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  39.79 
 
 
639 aa  114  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  30.19 
 
 
437 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  43.36 
 
 
280 aa  113  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  47.2 
 
 
686 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  40.67 
 
 
950 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  36.33 
 
 
907 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  38.91 
 
 
561 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  35.95 
 
 
245 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  41.54 
 
 
232 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  42.05 
 
 
938 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  33.09 
 
 
855 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  43.09 
 
 
361 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  34.06 
 
 
824 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  31.25 
 
 
2911 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  33.55 
 
 
724 aa  108  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  34.8 
 
 
475 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  38.57 
 
 
795 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.94 
 
 
421 aa  107  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  34.26 
 
 
396 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  34.75 
 
 
556 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  45.18 
 
 
243 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  37.7 
 
 
1019 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  38.12 
 
 
257 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  38.11 
 
 
860 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>