More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1623 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  100 
 
 
613 aa  1129    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  41.24 
 
 
595 aa  232  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  41.29 
 
 
946 aa  229  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  47.51 
 
 
1400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.8 
 
 
1795 aa  203  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  38.13 
 
 
3954 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  41.37 
 
 
2954 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  40.59 
 
 
1534 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.95 
 
 
1279 aa  194  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.69 
 
 
1363 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  37.81 
 
 
1532 aa  190  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  41.41 
 
 
2105 aa  187  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  40.24 
 
 
965 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.29 
 
 
3427 aa  184  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  40.71 
 
 
526 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  36.07 
 
 
833 aa  177  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  40.28 
 
 
1164 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.74 
 
 
980 aa  171  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  38.76 
 
 
9867 aa  171  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  40.6 
 
 
1424 aa  170  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  44.71 
 
 
2145 aa  163  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  39.18 
 
 
1895 aa  162  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  40.63 
 
 
393 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  38.46 
 
 
2689 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  38.16 
 
 
4334 aa  159  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  44.49 
 
 
1287 aa  157  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  37.08 
 
 
3619 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  41.32 
 
 
615 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  41.6 
 
 
491 aa  152  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  37.13 
 
 
387 aa  150  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  41.87 
 
 
460 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  38.8 
 
 
363 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  37.43 
 
 
3619 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  32.26 
 
 
4800 aa  146  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.88 
 
 
2667 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  40.08 
 
 
341 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.34 
 
 
2678 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  47.24 
 
 
982 aa  144  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 
396 aa  143  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.56 
 
 
2668 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  34.77 
 
 
1499 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  31.47 
 
 
1855 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  35.07 
 
 
387 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  40.23 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  32.25 
 
 
824 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  32.76 
 
 
1884 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  36.02 
 
 
3608 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  32.08 
 
 
3209 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  32.93 
 
 
1156 aa  127  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  38.14 
 
 
460 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  32.82 
 
 
1079 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  43.75 
 
 
1544 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  28.82 
 
 
556 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  36.59 
 
 
850 aa  124  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  39.43 
 
 
1043 aa  123  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  30.28 
 
 
795 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  32.08 
 
 
437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  34.39 
 
 
437 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  29.24 
 
 
860 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  42.08 
 
 
950 aa  117  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  34.85 
 
 
4687 aa  117  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  44.97 
 
 
606 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  29.48 
 
 
2911 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  35.39 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  41.57 
 
 
561 aa  115  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  33.24 
 
 
769 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.82 
 
 
1197 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.23 
 
 
1236 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.5 
 
 
588 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  31.14 
 
 
15831 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  38.85 
 
 
724 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  43.51 
 
 
686 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  43.64 
 
 
243 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.11 
 
 
2775 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  41.62 
 
 
361 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  40.32 
 
 
361 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  40.32 
 
 
361 aa  109  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  33.1 
 
 
734 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  40.89 
 
 
5171 aa  108  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  31.59 
 
 
14829 aa  108  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  32.92 
 
 
820 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  38.97 
 
 
589 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1287  VCBS  39.78 
 
 
610 aa  107  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.535504  normal  0.448224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  40.23 
 
 
327 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  32.4 
 
 
741 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  37.55 
 
 
813 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  31.09 
 
 
757 aa  104  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  37.99 
 
 
257 aa  104  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  37.8 
 
 
938 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  27.42 
 
 
745 aa  103  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  29.54 
 
 
1383 aa  103  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  35.22 
 
 
680 aa  103  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  36.79 
 
 
355 aa  103  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  41.62 
 
 
385 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  31.77 
 
 
4798 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.62 
 
 
1016 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  32.41 
 
 
736 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  32.34 
 
 
518 aa  102  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  45.95 
 
 
219 aa  102  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  33.89 
 
 
2836 aa  102  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>