More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0274 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
232 aa  437  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0275  Hemolysin-type calcium-binding region  50.86 
 
 
206 aa  188  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  46.86 
 
 
1279 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  44.81 
 
 
946 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.68 
 
 
3427 aa  121  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  44.27 
 
 
460 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  47.57 
 
 
833 aa  119  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  44.81 
 
 
595 aa  118  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  43.86 
 
 
3954 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  50.32 
 
 
709 aa  115  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.75 
 
 
980 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  50.33 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  45.11 
 
 
769 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  43.23 
 
 
1363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  43.82 
 
 
982 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.51 
 
 
1795 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  49.03 
 
 
813 aa  111  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  41.21 
 
 
1287 aa  111  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  42.19 
 
 
615 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  43.93 
 
 
2105 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  43.43 
 
 
361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  43.43 
 
 
361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  38.5 
 
 
1883 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  42.29 
 
 
4334 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  38.18 
 
 
460 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  43.08 
 
 
1424 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  41.95 
 
 
795 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  36.57 
 
 
526 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.55 
 
 
588 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  41.44 
 
 
2954 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  45.52 
 
 
491 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.19 
 
 
2668 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  46.2 
 
 
3619 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.6 
 
 
1963 aa  105  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  42.68 
 
 
243 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  39.77 
 
 
361 aa  105  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  41.35 
 
 
1534 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  45.57 
 
 
3619 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  39.76 
 
 
744 aa  105  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  41.45 
 
 
1164 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  43.32 
 
 
202 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  43.32 
 
 
202 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  43.83 
 
 
757 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.2 
 
 
1016 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  38.42 
 
 
741 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  42.01 
 
 
387 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 
572 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  40.51 
 
 
639 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  38.42 
 
 
734 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  41.35 
 
 
1532 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  44.97 
 
 
341 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  42.21 
 
 
824 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  44.08 
 
 
950 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  41.24 
 
 
686 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  49.63 
 
 
219 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  44.65 
 
 
280 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  43.93 
 
 
387 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  40.46 
 
 
257 aa  101  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.79 
 
 
421 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  44.03 
 
 
280 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  42.41 
 
 
4798 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  40.11 
 
 
5171 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  48.2 
 
 
1175 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  37.3 
 
 
437 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  43.75 
 
 
2885 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  37.61 
 
 
1400 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  42.53 
 
 
341 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  37.43 
 
 
393 aa  99  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  40 
 
 
1594 aa  98.6  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  43.87 
 
 
1895 aa  98.2  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  39.66 
 
 
938 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  45.64 
 
 
561 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  43.75 
 
 
2667 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  41.35 
 
 
1022 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1816  hemolysin-type calcium-binding region  40.85 
 
 
273 aa  96.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000360233  n/a   
 
 
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  39.25 
 
 
1855 aa  95.9  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  41.57 
 
 
355 aa  95.9  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  35.25 
 
 
437 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  40.85 
 
 
327 aa  95.1  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  42.48 
 
 
1499 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  43.15 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  42.24 
 
 
1383 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.75 
 
 
1236 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  37.91 
 
 
589 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  38.5 
 
 
2689 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  40.85 
 
 
363 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  39.77 
 
 
1544 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  40.83 
 
 
686 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  39.74 
 
 
613 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  53.54 
 
 
1156 aa  93.2  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  41.67 
 
 
606 aa  93.2  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  34.33 
 
 
4800 aa  92.4  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  43.88 
 
 
1538 aa  92.4  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  39.39 
 
 
467 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  43.92 
 
 
717 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.8 
 
 
2346 aa  92  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  40.31 
 
 
3587 aa  92  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  39.79 
 
 
396 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  41.14 
 
 
2145 aa  90.9  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>