More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1995 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
257 aa  500  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  44.63 
 
 
946 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.74 
 
 
980 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  46.59 
 
 
2954 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 
387 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  38.03 
 
 
526 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.84 
 
 
1279 aa  118  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.93 
 
 
3427 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  44.31 
 
 
1534 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  44.69 
 
 
1164 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  47.83 
 
 
950 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  41.21 
 
 
3954 aa  115  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  47.33 
 
 
813 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  39.23 
 
 
1287 aa  112  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  42.68 
 
 
1532 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  42.05 
 
 
833 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  41.08 
 
 
4334 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  38.89 
 
 
1424 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  50.74 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  40 
 
 
460 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  38.89 
 
 
355 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  37.97 
 
 
795 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  38.46 
 
 
1400 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  42.47 
 
 
424 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  42.16 
 
 
491 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  39.06 
 
 
595 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  38.12 
 
 
615 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
9867 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  42.07 
 
 
742 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  37.99 
 
 
613 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  40.68 
 
 
2885 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  36.32 
 
 
709 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  40.94 
 
 
2667 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  48.48 
 
 
219 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  43.03 
 
 
1895 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.26 
 
 
1363 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.31 
 
 
1795 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  39.77 
 
 
5171 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  42.11 
 
 
460 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  48.82 
 
 
202 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  48.82 
 
 
202 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  45 
 
 
734 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  43.23 
 
 
387 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  35.86 
 
 
363 aa  101  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.66 
 
 
1236 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.07 
 
 
2668 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  38.92 
 
 
982 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  40.46 
 
 
232 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  41.44 
 
 
2105 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  42.24 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.11 
 
 
588 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  44.38 
 
 
741 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.14 
 
 
1963 aa  99.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.38 
 
 
421 aa  99.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  43.7 
 
 
679 aa  99.4  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  41.01 
 
 
729 aa  99  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  35.44 
 
 
1079 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  37.14 
 
 
437 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  40.5 
 
 
850 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  47.01 
 
 
3619 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  47.01 
 
 
3619 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  41.28 
 
 
1197 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  43.24 
 
 
219 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  42.78 
 
 
396 aa  95.9  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  38.42 
 
 
686 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  35.32 
 
 
965 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  39.41 
 
 
341 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  41.61 
 
 
243 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1816  hemolysin-type calcium-binding region  40.12 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000360233  n/a   
 
 
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  36.49 
 
 
437 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  38.22 
 
 
393 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  43.71 
 
 
1544 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  42.96 
 
 
582 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  42.96 
 
 
585 aa  93.6  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  37.8 
 
 
938 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  36.31 
 
 
2145 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  45.08 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  45.08 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  42.22 
 
 
744 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  34.93 
 
 
561 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  40.23 
 
 
361 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  36.61 
 
 
327 aa  93.2  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  39.24 
 
 
724 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  30.88 
 
 
1855 aa  92.8  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  45.11 
 
 
639 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  39.44 
 
 
680 aa  92.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  44.53 
 
 
717 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  42.47 
 
 
1175 aa  92  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  43.14 
 
 
385 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  35.35 
 
 
341 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  44.96 
 
 
1712 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  42.01 
 
 
518 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29131  hypothetical protein  43.61 
 
 
934 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 
1043 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  37.85 
 
 
4798 aa  90.5  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  34.39 
 
 
589 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  45.74 
 
 
2775 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  32.64 
 
 
769 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  34.09 
 
 
824 aa  89.7  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  40.51 
 
 
686 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>