More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3353 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  94.62 
 
 		 3619 aa  6668    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  45.39 
 
 		 1650 aa  1035    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  46.43 
 
 		 3587 aa  785    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  46.24 
 
 		 3587 aa  784    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  42.37 
 
 		 2342 aa  1045    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  94.4 
 
 		 3619 aa  6651    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  42.31 
 
 		 2342 aa  1046    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  45.62 
 
 		 3094 aa  1058    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  41.78 
 
 		 1625 aa  939    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  41.33 
 
 		 2950 aa  1167    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  100 
 
 		 3608 aa  7120    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2871  Animal heme peroxidase  41.47 
 
 		 1712 aa  852    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  41.53 
 
 		 3209 aa  246  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  47.36 
 
 		 1855 aa  233  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  42.06 
 
 		 2807 aa  225  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  47.03 
 
 		 2954 aa  222  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.44 
 
 		 1415 aa  220  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  39.01 
 
 		 3954 aa  209  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  43.84 
 
 		 4334 aa  207  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  37.04 
 
 		 2133 aa  204  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.31 
 
 		 2775 aa  204  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  45.41 
 
 		 946 aa  202  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  35.9 
 
 		 2198 aa  202  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  38.96 
 
 		 2467 aa  197  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.35 
 
 		 1795 aa  193  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.16 
 
 		 2678 aa  191  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  37.39 
 
 		 1197 aa  189  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  40.16 
 
 		 1764 aa  189  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  44.54 
 
 		 1610 aa  187  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  36.67 
 
 		 824 aa  186  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  37.19 
 
 		 1134 aa  186  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  39.86 
 
 		 2105 aa  185  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  43.52 
 
 		 1029 aa  182  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.52 
 
 		 1029 aa  182  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  45.62 
 
 		 768 aa  180  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  39 
 
 		 1534 aa  178  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  40.28 
 
 		 3026 aa  174  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  37.67 
 
 		 851 aa  172  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 907 aa  172  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  37.23 
 
 		 1279 aa  171  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.85 
 
 		 3427 aa  172  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  43.48 
 
 		 395 aa  170  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  40.7 
 
 		 1145 aa  170  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  42.4 
 
 		 1424 aa  166  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  38.87 
 
 		 1363 aa  166  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  42.81 
 
 		 395 aa  166  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  34.77 
 
 		 2911 aa  166  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  37.06 
 
 		 1532 aa  165  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  40.8 
 
 		 2024 aa  164  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  38.64 
 
 		 475 aa  164  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  42.2 
 
 		 462 aa  164  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  38.21 
 
 		 1895 aa  163  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  37.4 
 
 		 1133 aa  161  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  47.62 
 
 		 1079 aa  160  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  35.37 
 
 		 4800 aa  160  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  38.05 
 
 		 475 aa  159  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  45.23 
 
 		 1610 aa  159  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  39.04 
 
 		 556 aa  158  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  34.95 
 
 		 2667 aa  158  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  35.69 
 
 		 1400 aa  157  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  46.88 
 
 		 503 aa  157  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  45.53 
 
 		 615 aa  155  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  40.75 
 
 		 393 aa  152  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  35.27 
 
 		 7284 aa  151  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  48.51 
 
 		 813 aa  151  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  45.7 
 
 		 503 aa  151  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 1582 aa  150  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.55 
 
 		 1236 aa  150  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  41.93 
 
 		 820 aa  149  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.25 
 
 		 980 aa  149  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  36.05 
 
 		 1499 aa  148  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  40.21 
 
 		 965 aa  147  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  36.92 
 
 		 613 aa  146  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.8 
 
 		 588 aa  146  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  39.19 
 
 		 3834 aa  146  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  37.01 
 
 		 341 aa  145  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  44.83 
 
 		 467 aa  145  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  38.72 
 
 		 1164 aa  144  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  36.75 
 
 		 2689 aa  144  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  35.6 
 
 		 526 aa  144  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  33.83 
 
 		 387 aa  144  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  45.61 
 
 		 686 aa  143  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  40.36 
 
 		 2345 aa  142  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  46.19 
 
 		 260 aa  142  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.77 
 
 		 2668 aa  142  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  39.3 
 
 		 1156 aa  140  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  33.9 
 
 		 9867 aa  139  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  32.57 
 
 		 1383 aa  139  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  36.69 
 
 		 595 aa  139  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  53.57 
 
 		 421 aa  138  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  38.34 
 
 		 1712 aa  137  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  32.85 
 
 		 959 aa  137  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  39.48 
 
 		 833 aa  136  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  29.24 
 
 		 4723 aa  136  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  52.67 
 
 		 709 aa  136  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  35.33 
 
 		 2145 aa  136  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  34.72 
 
 		 1287 aa  135  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  41.21 
 
 		 341 aa  134  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  33.05 
 
 		 1213 aa  133  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  54.61 
 
 		 982 aa  133  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>