More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1100 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  47.81 
 
 		 2024 aa  672    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 2345 aa  4518    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  42.58 
 
 		 3834 aa  588  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  38.62 
 
 		 4120 aa  337  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  82.53 
 
 		 1052 aa  263  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  40.36 
 
 		 3608 aa  156  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  39.22 
 
 		 3619 aa  154  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  39.22 
 
 		 3619 aa  154  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2121  hemolysin-type calcium-binding region  46.04 
 
 		 368 aa  109  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190728  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.39 
 
 		 1884 aa  102  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4762  hemolysin-type calcium-binding region  40.13 
 
 		 172 aa  100  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  30.04 
 
 		 904 aa  100  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  47.73 
 
 		 375 aa  99  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  40.62 
 
 		 16311 aa  91.3  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  38.82 
 
 		 1126 aa  85.9  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  30.49 
 
 		 808 aa  84.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  27.18 
 
 		 4465 aa  80.5  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.71 
 
 		 1180 aa  79.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  32.56 
 
 		 2950 aa  78.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.65 
 
 		 3977 aa  75.9  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  35.22 
 
 		 1706 aa  75.5  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  43.59 
 
 		 2182 aa  75.5  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  27.88 
 
 		 910 aa  74.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  29.17 
 
 		 4791 aa  73.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  34.3 
 
 		 1610 aa  73.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.75 
 
 		 4220 aa  73.6  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  34.8 
 
 		 1610 aa  73.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  37.5 
 
 		 1143 aa  72.8  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  31.08 
 
 		 2377 aa  72.8  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  29.21 
 
 		 4214 aa  72.4  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  35.43 
 
 		 621 aa  70.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.98 
 
 		 3363 aa  70.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  35.43 
 
 		 621 aa  70.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  32.99 
 
 		 6678 aa  70.1  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  32.99 
 
 		 1839 aa  68.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  33.33 
 
 		 856 aa  67.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  32.32 
 
 		 889 aa  68.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  35 
 
 		 1554 aa  67.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4119  hypothetical protein  38.58 
 
 		 129 aa  68.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0916185  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.26 
 
 		 11716 aa  68.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  46.24 
 
 		 1166 aa  66.6  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  34.85 
 
 		 1864 aa  66.2  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  31.47 
 
 		 998 aa  65.9  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  39.53 
 
 		 1699 aa  65.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  43.14 
 
 		 2704 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  31.6 
 
 		 1168 aa  64.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  30 
 
 		 1079 aa  64.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  41.05 
 
 		 2768 aa  63.5  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  28.85 
 
 		 515 aa  63.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  33.17 
 
 		 901 aa  62.8  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  32.51 
 
 		 9867 aa  63.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  37.62 
 
 		 373 aa  62  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  35.81 
 
 		 475 aa  62.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  30.28 
 
 		 2555 aa  62.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  41.56 
 
 		 709 aa  62.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  48.68 
 
 		 1079 aa  61.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.33 
 
 		 868 aa  61.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  57.38 
 
 		 2667 aa  61.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  26.91 
 
 		 3474 aa  61.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  40 
 
 		 3714 aa  61.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  57.81 
 
 		 424 aa  61.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  42.05 
 
 		 850 aa  61.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  28.37 
 
 		 467 aa  60.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  44.74 
 
 		 1650 aa  60.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  35.14 
 
 		 475 aa  60.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  41.74 
 
 		 411 aa  60.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  32.29 
 
 		 1403 aa  60.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  46.46 
 
 		 2178 aa  60.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.43 
 
 		 1553 aa  60.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  33.91 
 
 		 1883 aa  60.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  41.67 
 
 		 2452 aa  60.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  35.37 
 
 		 516 aa  60.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  34.48 
 
 		 4687 aa  60.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  30.08 
 
 		 998 aa  60.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  47.3 
 
 		 2885 aa  60.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  32.92 
 
 		 820 aa  60.1  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  30.04 
 
 		 938 aa  60.1  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  36.22 
 
 		 7284 aa  59.7  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  29.84 
 
 		 2245 aa  59.3  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  41.67 
 
 		 4379 aa  59.3  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  53.7 
 
 		 7072 aa  59.3  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971517 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  30.77 
 
 		 3182 aa  59.3  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  44.71 
 
 		 4798 aa  59.3  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.13 
 
 		 1963 aa  59.3  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  35.06 
 
 		 7149 aa  58.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  62.5 
 
 		 553 aa  58.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 		 3954 aa  58.9  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  52.24 
 
 		 1134 aa  58.9  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  41.13 
 
 		 2567 aa  58.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  35.88 
 
 		 946 aa  58.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2545  hemolysin-type calcium-binding region  53.7 
 
 		 4451 aa  58.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  49.33 
 
 		 4106 aa  58.2  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  43.75 
 
 		 855 aa  58.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  37.78 
 
 		 526 aa  58.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.67 
 
 		 1029 aa  57.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  35.96 
 
 		 3026 aa  58.2  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.3 
 
 		 2239 aa  57.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  47.3 
 
 		 6779 aa  58.2  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  31.67 
 
 		 1029 aa  57.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  47.3 
 
 		 6662 aa  57.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>