More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0714 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  100 
 
 		 1134 aa  2241    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2594  Hemolysin-type calcium-binding region  61.32 
 
 		 1099 aa  240  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  35.77 
 
 		 1421 aa  184  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  54.2 
 
 		 1971 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  37.75 
 
 		 1631 aa  124  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  37.05 
 
 		 1202 aa  122  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.66 
 
 		 3391 aa  119  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  36.59 
 
 		 2193 aa  108  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  33.33 
 
 		 5899 aa  97.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  32.32 
 
 		 4723 aa  90.9  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  26.44 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.63 
 
 		 5787 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  31.43 
 
 		 938 aa  72  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  29.83 
 
 		 2342 aa  71.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  29.83 
 
 		 2342 aa  71.2  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  26.75 
 
 		 3608 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  28.89 
 
 		 2796 aa  68.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  37.82 
 
 		 1805 aa  68.6  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  31.61 
 
 		 1323 aa  68.6  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  32.21 
 
 		 1632 aa  68.6  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.39 
 
 		 2689 aa  67  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.73 
 
 		 1806 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  31.51 
 
 		 830 aa  65.5  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  28.1 
 
 		 959 aa  64.3  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  27.91 
 
 		 860 aa  63.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  26.94 
 
 		 3619 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  38.37 
 
 		 4231 aa  62  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  41.74 
 
 		 942 aa  61.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  28.52 
 
 		 4687 aa  61.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  34.97 
 
 		 7284 aa  60.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  41.51 
 
 		 1389 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  28.11 
 
 		 462 aa  60.1  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  47.47 
 
 		 1145 aa  60.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  24.42 
 
 		 2145 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.16 
 
 		 3193 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  28.27 
 
 		 2890 aa  60.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  28.96 
 
 		 1055 aa  60.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  28.43 
 
 		 2701 aa  60.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  28.72 
 
 		 3619 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  42.35 
 
 		 3209 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  51.61 
 
 		 1019 aa  58.9  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  52.24 
 
 		 2345 aa  58.9  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  62.26 
 
 		 1052 aa  58.9  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  43.43 
 
 		 1712 aa  58.9  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  41.28 
 
 		 2667 aa  58.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  26.67 
 
 		 2079 aa  58.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  31.43 
 
 		 2853 aa  58.2  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  57.14 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  42.86 
 
 		 2807 aa  57.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  39.66 
 
 		 2133 aa  57.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  33.93 
 
 		 3314 aa  57.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  63.83 
 
 		 2911 aa  57.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  34.72 
 
 		 1346 aa  57.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.34 
 
 		 1963 aa  57.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.43 
 
 		 2507 aa  57.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  29.21 
 
 		 1134 aa  57  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  31.06 
 
 		 621 aa  57  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.1 
 
 		 1236 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  65.31 
 
 		 2704 aa  56.6  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  28.62 
 
 		 867 aa  56.6  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  28.91 
 
 		 2467 aa  57.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  31.76 
 
 		 946 aa  57  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  57.14 
 
 		 1883 aa  56.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  50.75 
 
 		 1699 aa  56.2  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  29.28 
 
 		 3026 aa  56.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  31.25 
 
 		 1021 aa  56.6  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.57 
 
 		 485 aa  56.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  27.27 
 
 		 4334 aa  56.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  26.7 
 
 		 2107 aa  55.8  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  65.22 
 
 		 757 aa  56.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0367  Hemolysin-type calcium-binding region  51.92 
 
 		 726 aa  55.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  60.42 
 
 		 1156 aa  55.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  47.62 
 
 		 1534 aa  55.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1313 aa  55.5  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  60.87 
 
 		 2198 aa  55.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.81 
 
 		 1415 aa  55.5  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  25.89 
 
 		 1112 aa  55.5  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  37.5 
 
 		 950 aa  55.1  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  41.22 
 
 		 850 aa  55.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  59.57 
 
 		 1462 aa  55.1  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  32.47 
 
 		 928 aa  55.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  29.97 
 
 		 2836 aa  55.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  27.86 
 
 		 820 aa  55.1  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.5 
 
 		 3427 aa  55.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  47.62 
 
 		 1532 aa  54.3  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  41.96 
 
 		 813 aa  54.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  60.42 
 
 		 5171 aa  54.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  36.36 
 
 		 688 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  36.24 
 
 		 2775 aa  53.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  58.33 
 
 		 1499 aa  53.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 589 aa  53.5  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  28.65 
 
 		 2296 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1424 aa  53.5  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  41.28 
 
 		 2885 aa  53.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  55.32 
 
 		 5769 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  38.4 
 
 		 1538 aa  53.5  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  45.57 
 
 		 767 aa  53.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  29.71 
 
 		 1363 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.68 
 
 		 418 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  34.88 
 
 		 2537 aa  53.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>