267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2596 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 1971 aa  3821    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2594  Hemolysin-type calcium-binding region  73.35 
 
 		 1099 aa  428  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  48.47 
 
 		 1134 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  44.12 
 
 		 759 aa  116  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  46.63 
 
 		 677 aa  108  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  52.03 
 
 		 2911 aa  103  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  41.82 
 
 		 833 aa  102  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  49.58 
 
 		 1145 aa  100  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  48.89 
 
 		 1884 aa  93.2  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  41.25 
 
 		 1112 aa  92  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  45.6 
 
 		 1544 aa  92  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  44.93 
 
 		 1112 aa  90.5  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  52.78 
 
 		 1213 aa  90.1  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  40.65 
 
 		 4800 aa  88.6  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  43.79 
 
 		 1072 aa  88.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.38 
 
 		 1236 aa  88.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  44.19 
 
 		 2667 aa  87  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  47.14 
 
 		 2836 aa  87  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  38.69 
 
 		 2097 aa  86.3  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  49.17 
 
 		 1582 aa  82  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  36.88 
 
 		 648 aa  80.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  40.85 
 
 		 1864 aa  80.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  43.8 
 
 		 2775 aa  81.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  39.71 
 
 		 745 aa  80.1  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.95 
 
 		 2678 aa  79  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  42.62 
 
 		 1424 aa  78.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  41.35 
 
 		 1079 aa  78.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  37.89 
 
 		 4687 aa  76.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  53.66 
 
 		 1390 aa  75.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  37.93 
 
 		 2887 aa  74.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  42.15 
 
 		 1557 aa  74.7  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  38.97 
 
 		 795 aa  74.7  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  39.61 
 
 		 2885 aa  73.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  36.79 
 
 		 556 aa  72.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  45.08 
 
 		 950 aa  72.4  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  45.54 
 
 		 1610 aa  71.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  39.19 
 
 		 1610 aa  70.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  33.8 
 
 		 639 aa  69.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2509  hemolysin-type calcium-binding region  38.58 
 
 		 865 aa  68.6  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  36.07 
 
 		 1400 aa  67.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  46.24 
 
 		 764 aa  67.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 		 1712 aa  68.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  34.33 
 
 		 574 aa  67  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  36.84 
 
 		 1883 aa  65.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  35.21 
 
 		 1286 aa  65.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.1 
 
 		 421 aa  65.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  36.62 
 
 		 3954 aa  64.3  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  45.71 
 
 		 1628 aa  63.9  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  33.15 
 
 		 572 aa  63.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 561 aa  63.2  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  36.5 
 
 		 1895 aa  61.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3067  hypothetical protein  29.63 
 
 		 405 aa  61.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  34.67 
 
 		 2467 aa  62  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4160  VCBS  33.16 
 
 		 6581 aa  61.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.530259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  37.29 
 
 		 327 aa  61.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  38.64 
 
 		 396 aa  60.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  35.54 
 
 		 833 aa  60.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  31.74 
 
 		 2133 aa  60.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  32.52 
 
 		 2145 aa  60.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  37.7 
 
 		 1164 aa  59.7  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  31.07 
 
 		 769 aa  59.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  38.84 
 
 		 867 aa  59.7  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  37.88 
 
 		 3619 aa  59.3  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  37.88 
 
 		 3619 aa  59.3  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  36.8 
 
 		 1175 aa  59.3  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.02 
 
 		 1963 aa  59.3  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  35.77 
 
 		 709 aa  58.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  30.96 
 
 		 727 aa  58.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 		 3427 aa  58.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.03 
 
 		 2668 aa  58.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  41.3 
 
 		 559 aa  58.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  38.93 
 
 		 965 aa  57.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  35.04 
 
 		 485 aa  57.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  29.05 
 
 		 260 aa  58.2  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 475 aa  57  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  36.07 
 
 		 257 aa  57  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  36.96 
 
 		 3209 aa  57  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  32.17 
 
 		 387 aa  57.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  31.67 
 
 		 491 aa  57.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  36.13 
 
 		 387 aa  57  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.53 
 
 		 1197 aa  57  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  34.87 
 
 		 467 aa  57  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  33.11 
 
 		 1287 aa  57.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  35.51 
 
 		 820 aa  57.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  33.88 
 
 		 728 aa  57  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  35.42 
 
 		 724 aa  57  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.08 
 
 		 1016 aa  57  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  32.02 
 
 		 2198 aa  57  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.25 
 
 		 1795 aa  56.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  34.39 
 
 		 4334 aa  56.6  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  35.77 
 
 		 850 aa  56.6  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  37.6 
 
 		 757 aa  56.6  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.61 
 
 		 588 aa  56.6  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  32.64 
 
 		 729 aa  56.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  40.32 
 
 		 2567 aa  56.2  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  34.97 
 
 		 785 aa  56.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  35.48 
 
 		 621 aa  56.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  39.83 
 
 		 424 aa  55.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 		 361 aa  55.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  37.19 
 
 		 460 aa  56.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>