More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2690 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 767 aa  1535    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  52.24 
 
 		 1043 aa  540  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  51.28 
 
 		 854 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  33.51 
 
 		 589 aa  201  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  35.05 
 
 		 561 aa  190  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  37.97 
 
 		 950 aa  173  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  31.34 
 
 		 833 aa  162  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  41.28 
 
 		 207 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  40.7 
 
 		 207 aa  132  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  28.49 
 
 		 792 aa  130  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  34.11 
 
 		 1462 aa  129  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  42.6 
 
 		 319 aa  128  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  45.14 
 
 		 353 aa  127  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  33.41 
 
 		 1534 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  39.43 
 
 		 946 aa  124  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  36.87 
 
 		 2775 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.88 
 
 		 3427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  33.11 
 
 		 1499 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  36.71 
 
 		 220 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.36 
 
 		 2667 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  34.65 
 
 		 437 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  36.68 
 
 		 322 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  37.63 
 
 		 354 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.01 
 
 		 1795 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  31.44 
 
 		 425 aa  112  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  30.59 
 
 		 942 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  34.15 
 
 		 2954 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0508  Hemolysin-type calcium-binding region  33.24 
 
 		 534 aa  111  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  34.65 
 
 		 437 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  39.01 
 
 		 232 aa  110  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  39.13 
 
 		 1532 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  29.61 
 
 		 959 aa  108  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.19 
 
 		 2678 aa  108  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  38.8 
 
 		 1279 aa  107  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  34.58 
 
 		 530 aa  107  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  38.28 
 
 		 3954 aa  107  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  32.67 
 
 		 1156 aa  107  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 4334 aa  107  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0833  hemolysin-type calcium-binding region  28.84 
 
 		 571 aa  105  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  33.94 
 
 		 3598 aa  105  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  29.58 
 
 		 4798 aa  105  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  36.78 
 
 		 491 aa  104  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  33.72 
 
 		 364 aa  104  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  28.12 
 
 		 1480 aa  104  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  33.42 
 
 		 595 aa  103  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  34.96 
 
 		 1400 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  36.64 
 
 		 1164 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.19 
 
 		 1236 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  35.08 
 
 		 387 aa  101  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  40.38 
 
 		 352 aa  100  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  30.53 
 
 		 2689 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  29.1 
 
 		 860 aa  99.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  30.44 
 
 		 820 aa  99.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  30.89 
 
 		 2911 aa  98.6  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  36.11 
 
 		 398 aa  98.6  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.65 
 
 		 980 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  33.33 
 
 		 460 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  35.88 
 
 		 369 aa  98.2  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  31.93 
 
 		 556 aa  98.2  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  34.05 
 
 		 2105 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  32.79 
 
 		 393 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  30.73 
 
 		 855 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  36.14 
 
 		 387 aa  96.3  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  30.47 
 
 		 2245 aa  95.5  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  34.94 
 
 		 518 aa  95.1  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  38.86 
 
 		 1287 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  29.28 
 
 		 3209 aa  94.7  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  34.8 
 
 		 357 aa  94.7  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  34.91 
 
 		 9867 aa  94.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  36.08 
 
 		 1712 aa  94.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  36.48 
 
 		 1424 aa  94  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  33.45 
 
 		 526 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  33.96 
 
 		 3619 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  31.98 
 
 		 4800 aa  92.8  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  35.91 
 
 		 356 aa  92.8  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  32.11 
 
 		 965 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.94 
 
 		 2668 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.49 
 
 		 1363 aa  92  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  33.47 
 
 		 5171 aa  91.7  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.5 
 
 		 1415 aa  91.3  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  32.81 
 
 		 3619 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  31.31 
 
 		 613 aa  90.9  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  32.55 
 
 		 833 aa  91.3  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  32.9 
 
 		 1544 aa  90.1  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 387 aa  90.5  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.46 
 
 		 1197 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  29.02 
 
 		 928 aa  89.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  29.84 
 
 		 1383 aa  89.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  32.44 
 
 		 1855 aa  90.1  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  33.6 
 
 		 313 aa  89  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  35.27 
 
 		 1895 aa  89  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  32.77 
 
 		 1079 aa  88.6  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  32.47 
 
 		 982 aa  88.2  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 		 219 aa  88.2  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1306 aa  87.8  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  35.19 
 
 		 363 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  31.12 
 
 		 589 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  35.29 
 
 		 3608 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  29.09 
 
 		 2467 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  35.23 
 
 		 351 aa  86.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>