245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0030 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
462 aa  919    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.15 
 
 
418 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  42.19 
 
 
830 aa  95.5  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  42.86 
 
 
1313 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  32.95 
 
 
849 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
872 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  32.92 
 
 
521 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  33.54 
 
 
2296 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
1247 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
756 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  38.58 
 
 
1806 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  38.58 
 
 
1632 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  43.18 
 
 
603 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
1075 aa  68.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  40.95 
 
 
2342 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  40.95 
 
 
2342 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
857 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
1067 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  35.77 
 
 
2796 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1500  hypothetical protein  40 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
1317 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 
746 aa  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
1264 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2744  hypothetical protein  35.96 
 
 
133 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
1152 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
1152 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  40.28 
 
 
995 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  34.48 
 
 
574 aa  60.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.3 
 
 
1366 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  31.78 
 
 
1029 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.78 
 
 
1029 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  28.11 
 
 
1134 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  38.14 
 
 
361 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  34.59 
 
 
518 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  38.93 
 
 
1037 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  31.67 
 
 
678 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  38.14 
 
 
361 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  54.55 
 
 
479 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  29.44 
 
 
546 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  54.55 
 
 
475 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  54.55 
 
 
476 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  47.06 
 
 
448 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2480  hypothetical protein  37.04 
 
 
143 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.696042  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  47.76 
 
 
556 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.76 
 
 
2678 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4067  hypothetical protein  35.29 
 
 
1442 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.715218  normal  0.232276 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  44.05 
 
 
476 aa  57  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  36.89 
 
 
467 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  41.49 
 
 
681 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  51.52 
 
 
479 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  40.4 
 
 
532 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  40.54 
 
 
462 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  37.74 
 
 
744 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0367  Hemolysin-type calcium-binding region  44.78 
 
 
726 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  53.23 
 
 
1079 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  38.02 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
535 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  33.85 
 
 
917 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  35.59 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  28.22 
 
 
448 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  35.94 
 
 
395 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  42.17 
 
 
2524 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  39.81 
 
 
677 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  29.52 
 
 
597 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  35.04 
 
 
303 aa  53.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  32.56 
 
 
813 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  26.27 
 
 
503 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  46.58 
 
 
1610 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  34.25 
 
 
1019 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  48.48 
 
 
486 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  50 
 
 
481 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.51 
 
 
1236 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  50.77 
 
 
5171 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  32.14 
 
 
1805 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  49.28 
 
 
1133 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  33.62 
 
 
644 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  35.38 
 
 
652 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  37.72 
 
 
889 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  48.48 
 
 
2467 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  38.06 
 
 
2178 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  35.4 
 
 
907 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  32.8 
 
 
294 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  33.6 
 
 
294 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  35.14 
 
 
1839 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  40.74 
 
 
120 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
665 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
1301 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  44.78 
 
 
515 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.41 
 
 
2346 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  49.21 
 
 
1197 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  46.97 
 
 
478 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  28.83 
 
 
503 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  40.48 
 
 
474 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  44.87 
 
 
2954 aa  50.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4608  Hemolysin-type calcium-binding region  40.95 
 
 
491 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.912572 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  31.48 
 
 
1880 aa  50.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  42.47 
 
 
1610 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2553  Hemolysin-type calcium-binding region  46.97 
 
 
340 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  33.6 
 
 
294 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  45.95 
 
 
1403 aa  50.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>