49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2610 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  100 
 
 		 1313 aa  2501    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  56.88 
 
 		 830 aa  244  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 462 aa  95.1  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  41.73 
 
 		 1880 aa  84.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  31.98 
 
 		 2296 aa  82.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  50 
 
 		 603 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  41.54 
 
 		 1632 aa  79.7  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  40.62 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  40.62 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  41.54 
 
 		 1806 aa  78.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  39.06 
 
 		 2796 aa  75.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  37.93 
 
 		 2342 aa  71.6  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  37.93 
 
 		 2342 aa  71.6  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.94 
 
 		 418 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  40.62 
 
 		 849 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 361 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2744  hypothetical protein  37.89 
 
 		 133 aa  67  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 		 872 aa  66.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 857 aa  65.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 		 746 aa  65.1  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  41.86 
 
 		 521 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 1075 aa  63.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1500  hypothetical protein  39.76 
 
 		 245 aa  60.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  36.9 
 
 		 1805 aa  59.7  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  40.77 
 
 		 227 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 		 1317 aa  59.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 995 aa  59.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  44.32 
 
 		 644 aa  56.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2480  hypothetical protein  39.29 
 
 		 143 aa  56.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.696042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 		 1264 aa  55.5  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  31.16 
 
 		 1134 aa  55.5  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0464  surface array protein  44.32 
 
 		 1257 aa  53.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0478  surface layer protein SapA12  44.32 
 
 		 1109 aa  53.5  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0486  surface array protein  44.32 
 
 		 1106 aa  53.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0462  surface array protein  44.32 
 
 		 1106 aa  53.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  27.74 
 
 		 1971 aa  53.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  38.78 
 
 		 255 aa  52.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 1152 aa  52.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  38.55 
 
 		 115 aa  52  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  38.37 
 
 		 1152 aa  52  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1037 aa  51.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  41.67 
 
 		 665 aa  51.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 		 756 aa  50.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  38.55 
 
 		 120 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0490  surface array protein  41.1 
 
 		 1292 aa  49.7  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.799434  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0456  surface array protein  41.1 
 
 		 1164 aa  49.7  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.182741  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0206  hypothetical protein  49.06 
 
 		 441 aa  48.5  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2594  Hemolysin-type calcium-binding region  23.87 
 
 		 1099 aa  46.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.23 
 
 		 1366 aa  46.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>