More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0436 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.91 
 
 		 4122 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  62.3 
 
 		 4836 aa  653    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  63.79 
 
 		 5442 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  59.54 
 
 		 4791 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 5787 aa  11000    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  63.75 
 
 		 5839 aa  674    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.91 
 
 		 2812 aa  603  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  61.47 
 
 		 4285 aa  600  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  64.3 
 
 		 6683 aa  560  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  64.3 
 
 		 6779 aa  560  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  62.63 
 
 		 2768 aa  536  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  63.75 
 
 		 6662 aa  533  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  45.96 
 
 		 7149 aa  481  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  64.5 
 
 		 1166 aa  477  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  37.69 
 
 		 1867 aa  400  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.3 
 
 		 2239 aa  359  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  42.77 
 
 		 4848 aa  356  5.9999999999999994e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.59 
 
 		 5962 aa  346  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  40.11 
 
 		 5218 aa  318  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  40.18 
 
 		 6753 aa  317  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 		 4678 aa  316  9e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  38.55 
 
 		 8682 aa  315  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  39.57 
 
 		 9030 aa  315  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.23 
 
 		 4220 aa  301  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  42.95 
 
 		 2251 aa  262  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  35.09 
 
 		 1631 aa  252  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  47.57 
 
 		 5444 aa  236  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  30.24 
 
 		 2193 aa  234  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  36.94 
 
 		 5745 aa  216  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  35.19 
 
 		 1597 aa  206  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  46.49 
 
 		 16322 aa  199  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  42.46 
 
 		 3259 aa  192  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  28.49 
 
 		 3191 aa  191  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  28.97 
 
 		 2890 aa  184  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  28.19 
 
 		 3391 aa  176  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.28 
 
 		 1599 aa  169  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  52.51 
 
 		 4214 aa  168  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  42.93 
 
 		 2542 aa  159  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  47.21 
 
 		 3182 aa  155  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  32.93 
 
 		 4978 aa  149  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.94 
 
 		 1884 aa  145  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  26.66 
 
 		 2079 aa  144  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  30.15 
 
 		 686 aa  139  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  36.62 
 
 		 2816 aa  138  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  25.06 
 
 		 3544 aa  133  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  25.99 
 
 		 2853 aa  128  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  31.22 
 
 		 814 aa  128  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  37.07 
 
 		 1706 aa  127  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  23.74 
 
 		 3699 aa  123  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  31.72 
 
 		 2555 aa  122  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  26.24 
 
 		 2820 aa  121  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  27.12 
 
 		 2454 aa  120  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  33.19 
 
 		 3927 aa  117  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.58 
 
 		 2807 aa  116  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  25.48 
 
 		 3244 aa  115  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  40.17 
 
 		 8321 aa  115  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.95 
 
 		 1553 aa  115  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  28.6 
 
 		 7919 aa  112  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  33.94 
 
 		 3184 aa  111  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.78 
 
 		 2067 aa  107  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  43.12 
 
 		 3229 aa  104  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  43.26 
 
 		 1699 aa  104  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 		 2524 aa  103  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  43.9 
 
 		 542 aa  103  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  39.41 
 
 		 4854 aa  102  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  22.5 
 
 		 3699 aa  101  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  29.63 
 
 		 2743 aa  100  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  31 
 
 		 1269 aa  98.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  32.49 
 
 		 1268 aa  98.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  27.39 
 
 		 7679 aa  95.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  29.41 
 
 		 1428 aa  94.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  32.37 
 
 		 1269 aa  94  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  38.25 
 
 		 3314 aa  92.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.78 
 
 		 3363 aa  92.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.31 
 
 		 3816 aa  92.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  29.01 
 
 		 2353 aa  89.7  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  40.85 
 
 		 2887 aa  88.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  30.77 
 
 		 1421 aa  88.2  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  26.65 
 
 		 2767 aa  87.8  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  41.73 
 
 		 2452 aa  85.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.66 
 
 		 2114 aa  85.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  30.18 
 
 		 721 aa  83.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  30.85 
 
 		 892 aa  83.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  32.66 
 
 		 3477 aa  80.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  40.77 
 
 		 1883 aa  80.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  27.78 
 
 		 9867 aa  78.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  37.35 
 
 		 1598 aa  78.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  35.33 
 
 		 2125 aa  77.4  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  35.44 
 
 		 2704 aa  77  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1952  triacylglycerol lipase  61.43 
 
 		 622 aa  75.5  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  37.59 
 
 		 6211 aa  75.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.04 
 
 		 2678 aa  73.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1424 aa  73.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  33.58 
 
 		 5123 aa  73.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  49.41 
 
 		 3091 aa  73.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  62.07 
 
 		 2296 aa  72.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  29.54 
 
 		 2839 aa  72.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.27 
 
 		 1073 aa  72.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  33.33 
 
 		 1202 aa  71.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3160  hemolysin-type calcium-binding region  58.82 
 
 		 523 aa  70.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.243046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>