More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1215 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  100 
 
 		 2542 aa  4879    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  59.14 
 
 		 4678 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  33.86 
 
 		 2042 aa  360  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  34.05 
 
 		 2127 aa  282  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  50.91 
 
 		 9030 aa  228  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  50.45 
 
 		 8682 aa  228  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.23 
 
 		 5962 aa  220  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  50.45 
 
 		 6753 aa  219  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  50.68 
 
 		 5218 aa  218  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.13 
 
 		 5098 aa  179  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.19 
 
 		 6683 aa  175  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  49.19 
 
 		 6779 aa  175  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  49.19 
 
 		 6662 aa  175  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  37.36 
 
 		 5171 aa  175  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.32 
 
 		 3396 aa  174  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.93 
 
 		 2239 aa  173  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.96 
 
 		 4836 aa  169  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.1 
 
 		 5839 aa  160  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.93 
 
 		 5787 aa  159  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  53.47 
 
 		 7149 aa  159  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  40.49 
 
 		 4285 aa  152  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.95 
 
 		 4122 aa  151  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  37.56 
 
 		 5444 aa  131  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  28.18 
 
 		 2768 aa  128  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  41.21 
 
 		 4848 aa  120  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 		 3259 aa  119  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  36.79 
 
 		 686 aa  107  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.03 
 
 		 4220 aa  104  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  39.56 
 
 		 2704 aa  103  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  38.25 
 
 		 3184 aa  103  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  26.81 
 
 		 5442 aa  103  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  41.03 
 
 		 1166 aa  101  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  44.44 
 
 		 4214 aa  100  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  47.66 
 
 		 2251 aa  99.8  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  43.83 
 
 		 1699 aa  98.2  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  47.37 
 
 		 16322 aa  96.7  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  43.06 
 
 		 4106 aa  96.3  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  41.25 
 
 		 2524 aa  95.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  40.76 
 
 		 2887 aa  92.8  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  52.08 
 
 		 3927 aa  92  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  46.73 
 
 		 8321 aa  91.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  57 
 
 		 1867 aa  90.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.57 
 
 		 994 aa  90.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  35.71 
 
 		 7679 aa  90.1  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  37.97 
 
 		 4854 aa  89  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  47.66 
 
 		 417 aa  88.6  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.33 
 
 		 850 aa  87.4  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  46.36 
 
 		 1883 aa  86.7  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.99 
 
 		 485 aa  86.3  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  43.7 
 
 		 2336 aa  86.3  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  45.97 
 
 		 542 aa  85.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  48.62 
 
 		 2452 aa  85.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  45.13 
 
 		 3314 aa  84.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  54.44 
 
 		 3619 aa  84  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  53.33 
 
 		 3619 aa  83.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  60 
 
 		 219 aa  83.2  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  52.27 
 
 		 817 aa  82.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  52.27 
 
 		 786 aa  83.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.24 
 
 		 2812 aa  82.8  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.71 
 
 		 1884 aa  82.8  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  39.31 
 
 		 2743 aa  82.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  53.68 
 
 		 1202 aa  82.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.94 
 
 		 980 aa  81.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  37.2 
 
 		 2377 aa  81.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  46.99 
 
 		 3263 aa  81.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.25 
 
 		 3427 aa  81.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  37.75 
 
 		 4791 aa  81.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  47 
 
 		 5769 aa  80.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  52.22 
 
 		 3608 aa  80.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2704  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  44.27 
 
 		 453 aa  80.5  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0626056 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  53.76 
 
 		 313 aa  80.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  37.01 
 
 		 686 aa  80.1  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.6 
 
 		 2507 aa  79.3  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.65 
 
 		 2346 aa  79.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  51 
 
 		 475 aa  79  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  35.55 
 
 		 221 aa  79  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  53.61 
 
 		 467 aa  79  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  51.55 
 
 		 715 aa  78.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  50 
 
 		 475 aa  77.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  42.11 
 
 		 2074 aa  78.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  41.18 
 
 		 3229 aa  78.2  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  39.5 
 
 		 767 aa  78.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  58.11 
 
 		 1594 aa  77.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  49.02 
 
 		 2296 aa  77.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  41.9 
 
 		 1141 aa  77.8  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.46 
 
 		 761 aa  77.4  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  50.63 
 
 		 1499 aa  77.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  54.76 
 
 		 161 aa  77  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  56.18 
 
 		 1403 aa  77  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  40.54 
 
 		 2125 aa  77  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  52.69 
 
 		 313 aa  77  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  65 
 
 		 1814 aa  76.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  35.79 
 
 		 4978 aa  75.9  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  36.56 
 
 		 260 aa  75.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  55.56 
 
 		 460 aa  75.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  52.17 
 
 		 303 aa  75.5  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  32.86 
 
 		 946 aa  75.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  56.41 
 
 		 1055 aa  75.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  29.76 
 
 		 4798 aa  74.7  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.13 
 
 		 1795 aa  75.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>