181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0388 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  48.23 
 
 		 5123 aa  2102    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  100 
 
 		 3263 aa  6457    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  47.72 
 
 		 6211 aa  2079    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  32.63 
 
 		 7919 aa  275  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0782  von Willebrand factor type A  30.78 
 
 		 5009 aa  206  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 		 6006 aa  194  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  32.45 
 
 		 7233 aa  189  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  25.36 
 
 		 3333 aa  177  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  30.44 
 
 		 2825 aa  145  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  27.32 
 
 		 5769 aa  144  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  30.84 
 
 		 3184 aa  139  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  29.29 
 
 		 4748 aa  119  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1846  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.73 
 
 		 4876 aa  107  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  27.57 
 
 		 2887 aa  104  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2545  hemolysin-type calcium-binding region  23.6 
 
 		 4451 aa  97.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  26.59 
 
 		 2524 aa  92.8  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1666  von Willebrand factor type A  28.66 
 
 		 1232 aa  91.3  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.854406  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  23.52 
 
 		 7072 aa  89.4  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971517 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  40.5 
 
 		 4678 aa  85.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3319  structural toxin protein RtxA  26.87 
 
 		 2159 aa  82.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  28.62 
 
 		 16311 aa  81.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  37.24 
 
 		 2251 aa  81.3  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  46.99 
 
 		 2542 aa  80.9  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.28 
 
 		 5962 aa  77.4  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  37.98 
 
 		 8682 aa  77  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  37.21 
 
 		 9030 aa  76.3  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  34.08 
 
 		 2377 aa  74.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  53.03 
 
 		 5218 aa  73.2  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  43.96 
 
 		 5444 aa  72.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  26.06 
 
 		 16322 aa  70.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  36.15 
 
 		 6753 aa  70.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.15 
 
 		 5839 aa  70.5  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  39.09 
 
 		 2890 aa  70.1  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1538 aa  70.1  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  30.77 
 
 		 7149 aa  69.7  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  25.68 
 
 		 2125 aa  69.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  35.48 
 
 		 2042 aa  68.6  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  24.71 
 
 		 2336 aa  68.6  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.58 
 
 		 3038 aa  68.6  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  44.94 
 
 		 2743 aa  68.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  47.19 
 
 		 4848 aa  68.6  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.34 
 
 		 2239 aa  66.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  25.77 
 
 		 3927 aa  65.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  46.34 
 
 		 6662 aa  65.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  46.34 
 
 		 6779 aa  65.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  36.94 
 
 		 998 aa  65.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.34 
 
 		 6683 aa  65.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  47.83 
 
 		 2768 aa  64.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  47.37 
 
 		 1424 aa  63.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  47.83 
 
 		 5442 aa  63.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.71 
 
 		 2812 aa  62  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  36.02 
 
 		 1403 aa  60.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  34.51 
 
 		 4285 aa  60.1  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.26 
 
 		 3314 aa  60.1  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  47.37 
 
 		 1610 aa  59.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  32.26 
 
 		 686 aa  60.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.34 
 
 		 4836 aa  59.7  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  40.54 
 
 		 4106 aa  59.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  34.53 
 
 		 817 aa  59.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.75 
 
 		 5787 aa  59.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  28.95 
 
 		 2784 aa  59.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  45.45 
 
 		 1699 aa  59.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.27 
 
 		 4220 aa  58.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  47.76 
 
 		 786 aa  58.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  44.87 
 
 		 1610 aa  57.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25821  hypothetical protein  42.5 
 
 		 1111 aa  57.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25851  hypothetical protein  42.5 
 
 		 1121 aa  57.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  44.57 
 
 		 417 aa  57.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  34.01 
 
 		 8321 aa  57.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  35.44 
 
 		 1839 aa  57.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  35.95 
 
 		 889 aa  57.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  46.75 
 
 		 1394 aa  57.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  38.83 
 
 		 998 aa  57.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  40.51 
 
 		 1166 aa  57  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1806 aa  56.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6263  hemolysin-type calcium-binding region  47.89 
 
 		 260 aa  56.6  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.43 
 
 		 1553 aa  56.6  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  38.64 
 
 		 1480 aa  56.6  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  39.19 
 
 		 621 aa  55.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  44.93 
 
 		 4214 aa  55.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 		 2678 aa  55.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  40.17 
 
 		 858 aa  55.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  42.17 
 
 		 327 aa  55.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  37.5 
 
 		 535 aa  54.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  37.5 
 
 		 999 aa  54.7  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.68 
 
 		 3363 aa  54.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  35.26 
 
 		 2345 aa  54.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  37.23 
 
 		 3229 aa  54.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  44.79 
 
 		 856 aa  54.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  43.53 
 
 		 901 aa  54.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  28.27 
 
 		 3182 aa  54.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  37.78 
 
 		 4854 aa  54.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  40.91 
 
 		 2452 aa  53.9  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  47.17 
 
 		 4791 aa  53.5  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  42.31 
 
 		 850 aa  53.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  38.38 
 
 		 1883 aa  53.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  43.24 
 
 		 411 aa  52.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2704  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  46.58 
 
 		 453 aa  52.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0626056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  34.44 
 
 		 517 aa  52.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  35.78 
 
 		 678 aa  52  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>