201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1367 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 
3396 aa  6559    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.66 
 
 
5098 aa  324  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.09 
 
 
1661 aa  205  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.32 
 
 
1800 aa  194  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1050  hypothetical protein  58.18 
 
 
314 aa  192  7e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.48 
 
 
1340 aa  186  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  26.33 
 
 
4013 aa  185  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  27.32 
 
 
2542 aa  175  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.51 
 
 
2194 aa  174  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  27.17 
 
 
2042 aa  173  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.84 
 
 
1222 aa  168  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  50 
 
 
6715 aa  166  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  29.55 
 
 
2127 aa  164  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.97 
 
 
1225 aa  164  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.44 
 
 
1113 aa  159  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.51 
 
 
1118 aa  158  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  26.38 
 
 
5899 aa  153  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  36.94 
 
 
1699 aa  143  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  33.55 
 
 
3191 aa  135  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.59 
 
 
1029 aa  135  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  38.06 
 
 
4748 aa  134  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.62 
 
 
994 aa  133  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  25.46 
 
 
1029 aa  130  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  33.91 
 
 
4854 aa  125  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.89 
 
 
1269 aa  125  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.89 
 
 
1269 aa  124  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  31.25 
 
 
1597 aa  123  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  34.45 
 
 
2251 aa  122  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.73 
 
 
3168 aa  120  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  31.02 
 
 
4978 aa  112  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  29.15 
 
 
1706 aa  110  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.92 
 
 
850 aa  109  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.48 
 
 
1012 aa  109  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  29.35 
 
 
1037 aa  104  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  31.7 
 
 
3474 aa  103  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  29.22 
 
 
2839 aa  100  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.58 
 
 
889 aa  99.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  32.34 
 
 
16322 aa  99.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  28.86 
 
 
3927 aa  97.1  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  28.92 
 
 
2074 aa  97.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  28.49 
 
 
8871 aa  96.7  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1846  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.96 
 
 
4876 aa  96.7  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.64 
 
 
1884 aa  95.5  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  30.31 
 
 
2555 aa  94.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  24.74 
 
 
4848 aa  93.6  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  27.98 
 
 
2767 aa  92.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.37 
 
 
1009 aa  92.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  29.21 
 
 
721 aa  91.7  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  27.13 
 
 
2887 aa  91.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.44 
 
 
761 aa  90.9  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  28.7 
 
 
7233 aa  90.5  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  33.63 
 
 
8321 aa  90.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  33.47 
 
 
7149 aa  89  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  30.53 
 
 
1867 aa  87.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  28.65 
 
 
1031 aa  87  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  29.78 
 
 
1269 aa  87  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  33.02 
 
 
5444 aa  85.9  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.62 
 
 
891 aa  85.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  28.82 
 
 
1268 aa  85.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  27.97 
 
 
2310 aa  85.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  34.15 
 
 
2305 aa  84.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  30.07 
 
 
1269 aa  84.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.44 
 
 
3816 aa  84  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  37.06 
 
 
912 aa  82.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.31 
 
 
768 aa  81.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  46.62 
 
 
3094 aa  80.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.52 
 
 
5745 aa  80.5  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.96 
 
 
928 aa  80.1  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  29.74 
 
 
814 aa  80.1  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.79 
 
 
4836 aa  79.7  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.74 
 
 
2812 aa  79.7  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  27.29 
 
 
2353 aa  79  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  28.01 
 
 
16311 aa  77.8  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  30.39 
 
 
3477 aa  77.4  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  43.2 
 
 
2816 aa  77.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  45.9 
 
 
9867 aa  76.3  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  32.58 
 
 
6006 aa  75.5  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  24.93 
 
 
9030 aa  75.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 
2825 aa  74.7  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.51 
 
 
3363 aa  73.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  24.76 
 
 
8682 aa  73.2  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.78 
 
 
1553 aa  73.2  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  29.05 
 
 
5769 aa  72  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  31.86 
 
 
2153 aa  71.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.26 
 
 
1180 aa  70.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  38.26 
 
 
715 aa  70.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.32 
 
 
369 aa  70.5  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.84 
 
 
1066 aa  70.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  26.6 
 
 
3714 aa  69.7  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.11 
 
 
1415 aa  69.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.43 
 
 
2507 aa  68.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.15 
 
 
4122 aa  68.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 
2524 aa  67.4  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  27.68 
 
 
1512 aa  67  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  27.03 
 
 
932 aa  66.6  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  41.03 
 
 
5218 aa  66.6  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  25.14 
 
 
4285 aa  66.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  27.33 
 
 
3089 aa  65.9  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  34.67 
 
 
1883 aa  65.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.58 
 
 
1599 aa  65.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>