190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0783 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 
4748 aa  9141    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  38.55 
 
 
7233 aa  1142    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1846  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.71 
 
 
4876 aa  1298    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  54.8 
 
 
6006 aa  599  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  48.17 
 
 
2825 aa  415  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  28.29 
 
 
2329 aa  375  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.03 
 
 
5098 aa  363  4e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0782  von Willebrand factor type A  40.77 
 
 
5009 aa  358  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  36.89 
 
 
7919 aa  325  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.95 
 
 
3396 aa  180  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1666  von Willebrand factor type A  30.16 
 
 
1232 aa  176  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.854406  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  32.37 
 
 
2887 aa  159  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  35.01 
 
 
3184 aa  144  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  31.25 
 
 
5123 aa  140  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  28.36 
 
 
5769 aa  139  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  30.42 
 
 
6211 aa  135  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  31.58 
 
 
2524 aa  130  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  30.13 
 
 
3263 aa  127  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.36 
 
 
3508 aa  110  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.59 
 
 
3038 aa  103  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  26.9 
 
 
16322 aa  102  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  25.46 
 
 
3333 aa  94.4  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  26.01 
 
 
5745 aa  94  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  26.96 
 
 
16311 aa  93.2  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  26.76 
 
 
1806 aa  91.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  25.05 
 
 
4978 aa  91.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  30 
 
 
1268 aa  84.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  30.69 
 
 
1269 aa  84  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  27 
 
 
1350 aa  84  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  31.97 
 
 
7149 aa  82.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  34.3 
 
 
1269 aa  80.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  26.15 
 
 
4285 aa  79  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  27.63 
 
 
2377 aa  75.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  25 
 
 
3259 aa  74.3  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 
3229 aa  73.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 
3816 aa  73.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  31.7 
 
 
721 aa  72  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.05 
 
 
761 aa  72  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.36 
 
 
1553 aa  72.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3319  structural toxin protein RtxA  26.5 
 
 
2159 aa  70.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.82 
 
 
850 aa  69.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  42.27 
 
 
1597 aa  68.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  37.72 
 
 
3486 aa  69.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  32.64 
 
 
1394 aa  68.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  47.19 
 
 
4896 aa  68.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.94 
 
 
2239 aa  68.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.88 
 
 
4122 aa  68.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.55 
 
 
2067 aa  68.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  50 
 
 
2602 aa  68.2  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.33 
 
 
1599 aa  68.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.76 
 
 
994 aa  67.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  37.79 
 
 
1706 aa  67  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  33.7 
 
 
3714 aa  66.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  28.76 
 
 
1867 aa  64.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  29.38 
 
 
3182 aa  64.7  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  40.65 
 
 
892 aa  64.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  29.61 
 
 
2537 aa  63.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  26.13 
 
 
7072 aa  63.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.971517 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2545  hemolysin-type calcium-binding region  26.13 
 
 
4451 aa  63.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1592  hypothetical protein  39.13 
 
 
570 aa  63.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  53.57 
 
 
814 aa  62.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.19 
 
 
3363 aa  62.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  40.43 
 
 
1367 aa  62  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.17 
 
 
1884 aa  62  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3228  autoaggregation protein  30.26 
 
 
232 aa  61.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2980  autoaggregation protein  31.25 
 
 
236 aa  61.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  43.33 
 
 
2267 aa  61.2  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  37.04 
 
 
3954 aa  61.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  27.7 
 
 
4854 aa  60.8  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  31.53 
 
 
3314 aa  60.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  26.88 
 
 
5561 aa  59.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  27.15 
 
 
5559 aa  59.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  30.65 
 
 
3793 aa  59.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.4 
 
 
2812 aa  60.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  27.15 
 
 
5559 aa  59.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  29.25 
 
 
2060 aa  58.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  54.24 
 
 
1035 aa  59.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  41.44 
 
 
2478 aa  58.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6333  autoaggregation protein  28.22 
 
 
237 aa  58.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  25.17 
 
 
2125 aa  58.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  44.55 
 
 
2456 aa  58.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  48.65 
 
 
2353 aa  58.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  26.88 
 
 
5561 aa  58.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  27.15 
 
 
5561 aa  58.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  35.5 
 
 
2336 aa  57.8  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  34.87 
 
 
2807 aa  57.4  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  35.34 
 
 
1022 aa  57.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  28.92 
 
 
3739 aa  57  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  38.33 
 
 
663 aa  57  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  27.95 
 
 
6310 aa  57  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  34.38 
 
 
1538 aa  57  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2620  outer membrane adhesin like proteiin  29.81 
 
 
513 aa  56.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160364  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  26.55 
 
 
3923 aa  56.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  40.45 
 
 
3471 aa  56.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  40.16 
 
 
2625 aa  56.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  39.47 
 
 
3927 aa  55.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  38.18 
 
 
877 aa  55.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  34.45 
 
 
3477 aa  56.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  28.78 
 
 
3721 aa  55.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  42.39 
 
 
653 aa  55.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>