175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3224 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 369 aa  748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.67 
 
 		 1884 aa  156  7e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  32.97 
 
 		 3927 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  30.03 
 
 		 892 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.18 
 
 		 2507 aa  146  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  32.76 
 
 		 4978 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.99 
 
 		 850 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  30.6 
 
 		 1597 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  34.29 
 
 		 2153 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  37.05 
 
 		 2816 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  34.78 
 
 		 2074 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  32.44 
 
 		 5745 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  30.07 
 
 		 2377 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.63 
 
 		 3816 aa  126  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.64 
 
 		 994 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  32.24 
 
 		 2767 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  35.77 
 
 		 7284 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.69 
 
 		 761 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  32.37 
 
 		 1867 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  29.75 
 
 		 1269 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.37 
 
 		 3363 aa  109  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  33.73 
 
 		 3474 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  28.62 
 
 		 1706 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  30.17 
 
 		 1268 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  32.01 
 
 		 2839 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.93 
 
 		 2114 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  27.09 
 
 		 1269 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  30.6 
 
 		 3191 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  38.29 
 
 		 715 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1512 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  29.18 
 
 		 4798 aa  99.4  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  30.4 
 
 		 3477 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.66 
 
 		 3089 aa  96.3  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  28.03 
 
 		 721 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.1 
 
 		 4220 aa  93.6  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  29.82 
 
 		 4848 aa  89.7  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  28.69 
 
 		 1363 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1416 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.88 
 
 		 1109 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  27.2 
 
 		 1367 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  29.61 
 
 		 3699 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  28.52 
 
 		 2715 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  29.81 
 
 		 1141 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27 
 
 		 2807 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  28.36 
 
 		 1712 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  29.15 
 
 		 2503 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  27.53 
 
 		 2476 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1750 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.85 
 
 		 1066 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  29.29 
 
 		 2353 aa  73.6  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  27.82 
 
 		 814 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  27.15 
 
 		 2522 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  37.86 
 
 		 2542 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  25.66 
 
 		 1215 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  24.46 
 
 		 1215 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.87 
 
 		 802 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  29.86 
 
 		 8321 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.37 
 
 		 1433 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.32 
 
 		 3396 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1538 aa  70.1  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.9 
 
 		 3699 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  28.12 
 
 		 1911 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  26.79 
 
 		 2555 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.47 
 
 		 1283 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  26.07 
 
 		 16322 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  25.08 
 
 		 1215 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.08 
 
 		 1215 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1002 aa  66.6  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  41.3 
 
 		 1518 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  27.62 
 
 		 3544 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  37.21 
 
 		 1502 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  28.74 
 
 		 16311 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  26.26 
 
 		 4687 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  29.8 
 
 		 5020 aa  63.9  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5004  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1039 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1879 aa  63.2  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  27.44 
 
 		 2145 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  24.84 
 
 		 4854 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  23.56 
 
 		 1215 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  41.41 
 
 		 1394 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  27.69 
 
 		 1428 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0847  putative outer membrane adhesin like protein  27.89 
 
 		 567 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189392  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.24 
 
 		 1286 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  27 
 
 		 4231 aa  60.1  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.36 
 
 		 1949 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.09 
 
 		 1292 aa  59.3  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  25.63 
 
 		 3758 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.14 
 
 		 1056 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  26.05 
 
 		 2056 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1126 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  38.46 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27866  predicted protein  22.75 
 
 		 3182 aa  56.6  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.46 
 
 		 1067 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  50.88 
 
 		 877 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  28.15 
 
 		 2924 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  26.37 
 
 		 663 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  27.78 
 
 		 9867 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  24.48 
 
 		 2784 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1297  hypothetical protein  37.5 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  22.56 
 
 		 1063 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>