204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1702 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  80.33 
 
 		 1416 aa  2257    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  100 
 
 		 1512 aa  3024    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  38.7 
 
 		 998 aa  343  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  38.91 
 
 		 991 aa  337  7e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  41.71 
 
 		 4978 aa  265  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  42.82 
 
 		 3927 aa  213  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  35.39 
 
 		 1597 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.54 
 
 		 2114 aa  203  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  38.23 
 
 		 5745 aa  199  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  40.46 
 
 		 2377 aa  194  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.54 
 
 		 1884 aa  193  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  35.44 
 
 		 2816 aa  176  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.2 
 
 		 850 aa  168  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  36.15 
 
 		 892 aa  164  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.47 
 
 		 994 aa  161  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  33.49 
 
 		 3191 aa  159  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.51 
 
 		 3816 aa  155  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  37.81 
 
 		 1269 aa  152  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  32.94 
 
 		 721 aa  151  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  35.91 
 
 		 1269 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 		 1268 aa  145  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  32.66 
 
 		 3474 aa  134  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  33.12 
 
 		 2153 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  34.63 
 
 		 1867 aa  134  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.62 
 
 		 2839 aa  127  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  32.22 
 
 		 2074 aa  127  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.98 
 
 		 2807 aa  126  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.12 
 
 		 761 aa  125  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.37 
 
 		 2507 aa  124  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  30.99 
 
 		 2353 aa  124  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  28.68 
 
 		 1367 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  30.87 
 
 		 1363 aa  122  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  31.91 
 
 		 3477 aa  110  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  27.42 
 
 		 1706 aa  108  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  30.52 
 
 		 4848 aa  108  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  30.07 
 
 		 2555 aa  105  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0288  hypothetical protein  30.71 
 
 		 315 aa  102  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0273006  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  27.37 
 
 		 1141 aa  102  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.38 
 
 		 369 aa  101  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.21 
 
 		 3363 aa  99.8  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.81 
 
 		 1066 aa  98.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  29.55 
 
 		 814 aa  97.1  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  28.57 
 
 		 1011 aa  94  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  28.33 
 
 		 9867 aa  94.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  26.68 
 
 		 1752 aa  91.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.72 
 
 		 4220 aa  90.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1781 aa  89.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  25.59 
 
 		 2767 aa  87  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  27.23 
 
 		 663 aa  85.5  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  28.08 
 
 		 4791 aa  85.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  29.49 
 
 		 1779 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  23.78 
 
 		 7284 aa  84  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.13 
 
 		 4836 aa  84.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  31.18 
 
 		 1428 aa  83.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  28.08 
 
 		 1215 aa  83.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.08 
 
 		 1215 aa  83.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  27.31 
 
 		 4798 aa  82.8  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  28.05 
 
 		 3699 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  27.44 
 
 		 1215 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  27.76 
 
 		 2503 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  27.34 
 
 		 3089 aa  80.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  31.76 
 
 		 2853 aa  79.7  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  27.23 
 
 		 5442 aa  79.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.97 
 
 		 3699 aa  79.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  29.95 
 
 		 16311 aa  79.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  28.94 
 
 		 8321 aa  79.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  27.44 
 
 		 1215 aa  79.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  27.44 
 
 		 1215 aa  79.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.67 
 
 		 1949 aa  79  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  27.56 
 
 		 2476 aa  78.6  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1006 aa  78.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  36.08 
 
 		 715 aa  77.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 722 aa  77  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  31.4 
 
 		 1712 aa  76.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  36.05 
 
 		 1750 aa  76.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1061 aa  75.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  29.12 
 
 		 1744 aa  75.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  26.33 
 
 		 3544 aa  75.1  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.01 
 
 		 1056 aa  75.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.87 
 
 		 1063 aa  74.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  30.25 
 
 		 666 aa  74.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  30.22 
 
 		 2820 aa  73.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  30 
 
 		 1109 aa  73.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1002 aa  72.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  42.39 
 
 		 974 aa  72.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  33.94 
 
 		 1911 aa  72  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.14 
 
 		 802 aa  70.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.1 
 
 		 777 aa  70.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2297  putative signal peptide protein  34.18 
 
 		 2742 aa  70.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.992598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  30.73 
 
 		 2522 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.44 
 
 		 5839 aa  68.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  27.94 
 
 		 7149 aa  68.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  28.3 
 
 		 2084 aa  68.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.87 
 
 		 6683 aa  67.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  30.28 
 
 		 634 aa  68.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  30.66 
 
 		 4285 aa  68.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  30.15 
 
 		 635 aa  68.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.49 
 
 		 1433 aa  68.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  31.87 
 
 		 6779 aa  67.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.61 
 
 		 4122 aa  66.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>