96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2008 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 3168 aa  6138    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2925  hypothetical protein  33.17 
 
 		 3138 aa  731    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.844856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0938  hypothetical protein  37.5 
 
 		 586 aa  216  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000915423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  34.92 
 
 		 1118 aa  202  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.73 
 
 		 3396 aa  122  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.68 
 
 		 2194 aa  110  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.53 
 
 		 1800 aa  110  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  38.4 
 
 		 2305 aa  107  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.37 
 
 		 1009 aa  107  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  36.2 
 
 		 2310 aa  106  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.07 
 
 		 1661 aa  102  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  37.54 
 
 		 1037 aa  100  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.4 
 
 		 1340 aa  97.8  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.98 
 
 		 1012 aa  94.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.17 
 
 		 891 aa  93.6  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.21 
 
 		 1269 aa  92.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.49 
 
 		 1222 aa  92.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.32 
 
 		 1225 aa  87.8  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.28 
 
 		 889 aa  82.8  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.61 
 
 		 1118 aa  82.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.78 
 
 		 2346 aa  81.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  26.06 
 
 		 15831 aa  82  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.48 
 
 		 1113 aa  81.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.7 
 
 		 928 aa  82  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  47.73 
 
 		 830 aa  80.5  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  30.55 
 
 		 5899 aa  79.7  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  27.67 
 
 		 12741 aa  78.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4726  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.8 
 
 		 826 aa  77  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.89 
 
 		 4122 aa  75.5  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  38.22 
 
 		 916 aa  75.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  39.09 
 
 		 932 aa  74.7  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.94 
 
 		 768 aa  73.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  40 
 
 		 8871 aa  73.9  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  38.18 
 
 		 750 aa  72.8  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.91 
 
 		 1269 aa  71.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50.68 
 
 		 1180 aa  70.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  50 
 
 		 1394 aa  69.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  39.18 
 
 		 3041 aa  69.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  34.16 
 
 		 1029 aa  66.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  27.95 
 
 		 1031 aa  66.6  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  49.23 
 
 		 453 aa  66.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.33 
 
 		 1029 aa  65.9  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  25.43 
 
 		 14829 aa  65.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.62 
 
 		 1415 aa  62.4  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  41.04 
 
 		 625 aa  62.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  35.45 
 
 		 16311 aa  61.6  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.16 
 
 		 547 aa  61.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4932  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  52.24 
 
 		 520 aa  60.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.908823  normal  0.398469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3672  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.34 
 
 		 255 aa  60.1  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  39.01 
 
 		 671 aa  59.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  40.89 
 
 		 605 aa  59.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6659  hypothetical protein  30.93 
 
 		 387 aa  58.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.86 
 
 		 979 aa  59.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  48.61 
 
 		 767 aa  58.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.83 
 
 		 647 aa  58.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  53.52 
 
 		 433 aa  57.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  59.32 
 
 		 846 aa  57  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  30.21 
 
 		 4013 aa  56.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.6 
 
 		 469 aa  56.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  28.47 
 
 		 4214 aa  56.6  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.5 
 
 		 911 aa  56.6  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  28.02 
 
 		 4672 aa  56.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1710  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.67 
 
 		 399 aa  55.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  28.52 
 
 		 8682 aa  55.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  32.48 
 
 		 1053 aa  55.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  37.3 
 
 		 551 aa  54.7  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  38.41 
 
 		 2313 aa  53.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  35.66 
 
 		 3394 aa  54.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  26.82 
 
 		 4848 aa  53.9  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  54.88 
 
 		 456 aa  53.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  33.19 
 
 		 1222 aa  53.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  57.38 
 
 		 1281 aa  51.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.77 
 
 		 1535 aa  51.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0174  hypothetical protein  36.96 
 
 		 438 aa  51.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.023441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.67 
 
 		 615 aa  51.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  50 
 
 		 914 aa  52  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.11 
 
 		 984 aa  51.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4037  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.49 
 
 		 513 aa  50.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158153 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2397  extensin family protein  32.17 
 
 		 362 aa  50.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  41.74 
 
 		 356 aa  50.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.65 
 
 		 5098 aa  49.3  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0647  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.6 
 
 		 410 aa  48.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000312807  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  36.08 
 
 		 1806 aa  48.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  36.08 
 
 		 1350 aa  48.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  43.33 
 
 		 572 aa  48.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  32.47 
 
 		 894 aa  48.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  32.5 
 
 		 873 aa  48.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  37.86 
 
 		 2796 aa  48.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  29.42 
 
 		 6753 aa  48.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0681  hypothetical protein  48.72 
 
 		 309 aa  48.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.735733 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  30.04 
 
 		 2251 aa  47.8  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  27.5 
 
 		 926 aa  47.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.87 
 
 		 913 aa  47.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  43.3 
 
 		 259 aa  46.2  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  37.27 
 
 		 840 aa  46.2  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  28.86 
 
 		 9030 aa  46.2  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>