78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4420 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  85.34 
 
 
9867 aa  866    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  100 
 
 
912 aa  1779    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  48.78 
 
 
3193 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  65.77 
 
 
3041 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  57.06 
 
 
690 aa  382  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  59.81 
 
 
940 aa  382  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.31 
 
 
1154 aa  300  7e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.24 
 
 
1372 aa  281  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  37.68 
 
 
2924 aa  237  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  87.29 
 
 
922 aa  194  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  36.93 
 
 
470 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  31.1 
 
 
7284 aa  163  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  40.47 
 
 
6678 aa  154  8.999999999999999e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  29.09 
 
 
16311 aa  144  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  31.56 
 
 
539 aa  137  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  29.93 
 
 
2555 aa  137  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  52.23 
 
 
5218 aa  122  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  36.84 
 
 
1308 aa  122  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  52.98 
 
 
5962 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  35.64 
 
 
760 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  36.09 
 
 
417 aa  110  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  48.7 
 
 
1143 aa  110  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  34.01 
 
 
409 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  32.96 
 
 
688 aa  107  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  30.92 
 
 
828 aa  105  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.54 
 
 
11716 aa  102  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  45.62 
 
 
2377 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  28.38 
 
 
3378 aa  101  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  43.11 
 
 
3927 aa  101  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  41.67 
 
 
5769 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  29.67 
 
 
3477 aa  96.3  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.94 
 
 
2678 aa  89.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1698  hypothetical protein  25.9 
 
 
1046 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.814773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  34.26 
 
 
1428 aa  85.1  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  29.88 
 
 
1757 aa  84.7  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  40.35 
 
 
1434 aa  83.2  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  27.78 
 
 
974 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  29.03 
 
 
861 aa  79  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  29.89 
 
 
4661 aa  78.6  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  30.87 
 
 
3066 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.41 
 
 
3396 aa  75.9  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  30.04 
 
 
506 aa  75.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  44.27 
 
 
3094 aa  75.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  26.39 
 
 
2060 aa  73.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  29.67 
 
 
2715 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  27.51 
 
 
2074 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  28.26 
 
 
3191 aa  68.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29474  predicted protein  33.55 
 
 
2031 aa  65.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00483469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  26.87 
 
 
1348 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  26.99 
 
 
2853 aa  61.2  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  28.65 
 
 
2001 aa  60.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 
621 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  34.65 
 
 
2345 aa  59.3  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5058  hypothetical protein  24.11 
 
 
927 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.530291  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  27.25 
 
 
3222 aa  57.4  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.23 
 
 
1490 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.81 
 
 
2807 aa  55.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  24.45 
 
 
604 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  32.47 
 
 
2820 aa  53.5  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.64 
 
 
1275 aa  52  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  22.56 
 
 
868 aa  51.6  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  28.25 
 
 
819 aa  51.6  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.69 
 
 
2194 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  27.6 
 
 
1706 aa  49.7  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.43 
 
 
994 aa  48.9  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  24.78 
 
 
2497 aa  48.5  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  28.33 
 
 
1201 aa  48.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  49.12 
 
 
3562 aa  48.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  29.21 
 
 
4231 aa  47.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  27.23 
 
 
1094 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  27.8 
 
 
534 aa  47.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.8 
 
 
1340 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  23.03 
 
 
3333 aa  45.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  31.41 
 
 
6276 aa  44.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  28.42 
 
 
8871 aa  44.7  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.52 
 
 
1225 aa  44.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  31.71 
 
 
3230 aa  44.7  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  25.59 
 
 
811 aa  44.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>