105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2872 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 621 aa  1264    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.23 
 
 		 635 aa  677    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.8 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.9 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.38 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  33.89 
 
 		 1126 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  24.9 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.39 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  33.97 
 
 		 1838 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.9 
 
 		 299 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.62 
 
 		 261 aa  72.8  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.71 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  27.38 
 
 		 1124 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  30.89 
 
 		 1490 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  29.07 
 
 		 1127 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  27.27 
 
 		 604 aa  70.5  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  29.58 
 
 		 3193 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  30.6 
 
 		 1282 aa  69.7  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  26.29 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  27.61 
 
 		 1348 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  34.44 
 
 		 974 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  27.6 
 
 		 1337 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.22 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.98 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.64 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  24.85 
 
 		 1346 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.96 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  30.65 
 
 		 409 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  27.99 
 
 		 828 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  26.05 
 
 		 1433 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  24.75 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1289 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.15 
 
 		 280 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.62 
 
 		 303 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  29.39 
 
 		 912 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  23.72 
 
 		 2558 aa  60.5  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.12 
 
 		 258 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.62 
 
 		 289 aa  59.3  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  31.65 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  32.38 
 
 		 2094 aa  58.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.19 
 
 		 2807 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  23.19 
 
 		 270 aa  57  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  25.89 
 
 		 494 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1638 aa  54.3  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  24.06 
 
 		 1437 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.01 
 
 		 291 aa  53.9  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  28.22 
 
 		 1094 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  26.34 
 
 		 2448 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.23 
 
 		 262 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  27.8 
 
 		 412 aa  53.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  27.88 
 
 		 921 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.21 
 
 		 2032 aa  52  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  30.04 
 
 		 2497 aa  52  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  26.69 
 
 		 1827 aa  51.6  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  23.39 
 
 		 2031 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.39 
 
 		 1806 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.39 
 
 		 1825 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.39 
 
 		 1825 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  23.48 
 
 		 232 aa  50.4  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.39 
 
 		 2031 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  30.95 
 
 		 690 aa  50.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.39 
 
 		 2031 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  28.81 
 
 		 1019 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0998  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.74 
 
 		 248 aa  50.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0392935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  33.86 
 
 		 760 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.83 
 
 		 262 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3320  FG-GAP repeat-containing protein  23.48 
 
 		 529 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26071  predicted protein  20.51 
 
 		 578 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.465211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4328  hypothetical protein  26.34 
 
 		 288 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  26.25 
 
 		 1109 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  26.23 
 
 		 657 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  30.25 
 
 		 1557 aa  48.5  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  29.44 
 
 		 386 aa  48.9  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  27.16 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.62 
 
 		 312 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  22.96 
 
 		 302 aa  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  28.85 
 
 		 417 aa  48.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  25.86 
 
 		 1172 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  26.52 
 
 		 685 aa  48.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  25.59 
 
 		 883 aa  47.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  26.95 
 
 		 485 aa  47.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.56 
 
 		 1154 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.98 
 
 		 891 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.74 
 
 		 2194 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09260  conserved hypothetical protein  27.5 
 
 		 869 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0483373  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  28.14 
 
 		 8871 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  24.41 
 
 		 554 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  26.18 
 
 		 749 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  21.78 
 
 		 2554 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  25.2 
 
 		 491 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.68 
 
 		 269 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.05 
 
 		 11716 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  25 
 
 		 402 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  25.1 
 
 		 2413 aa  44.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  26.61 
 
 		 469 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.01 
 
 		 282 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.98 
 
 		 236 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  23.99 
 
 		 1976 aa  44.3  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  31.54 
 
 		 1275 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>