101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2524 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  100 
 
 		 1143 aa  2267    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  56.78 
 
 		 2476 aa  244  6e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  45.02 
 
 		 1911 aa  237  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  53.85 
 
 		 6678 aa  164  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  45.91 
 
 		 2924 aa  128  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  45.89 
 
 		 2555 aa  120  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.53 
 
 		 11716 aa  114  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  35.06 
 
 		 1428 aa  103  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  48.03 
 
 		 9867 aa  102  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  49.66 
 
 		 912 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.6 
 
 		 2678 aa  89  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  36.08 
 
 		 2060 aa  88.2  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  31.14 
 
 		 16311 aa  75.9  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 2345 aa  72.4  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  29.17 
 
 		 2715 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  32.91 
 
 		 917 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  35.38 
 
 		 5218 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  37.41 
 
 		 2461 aa  66.2  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.94 
 
 		 5962 aa  65.1  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1151 aa  62.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  35.14 
 
 		 5094 aa  63.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  30.97 
 
 		 1019 aa  61.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  30.97 
 
 		 1055 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  26.44 
 
 		 1022 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  26.44 
 
 		 1017 aa  61.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  37.32 
 
 		 3439 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  39 
 
 		 1434 aa  60.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  32.41 
 
 		 3378 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.82 
 
 		 3427 aa  59.3  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.57 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  29.94 
 
 		 1175 aa  58.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  34.69 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  37.3 
 
 		 3094 aa  57.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  32.65 
 
 		 3714 aa  57.4  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  28.57 
 
 		 2853 aa  57.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  23.37 
 
 		 938 aa  56.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  41.96 
 
 		 922 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.45 
 
 		 588 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.44 
 
 		 2507 aa  55.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  35.14 
 
 		 4661 aa  55.1  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.75 
 
 		 813 aa  55.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  28.48 
 
 		 395 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  33.33 
 
 		 3927 aa  54.7  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  25.73 
 
 		 2743 aa  54.7  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  26.95 
 
 		 1037 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  34.15 
 
 		 2820 aa  54.3  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.81 
 
 		 1884 aa  53.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.61 
 
 		 1599 aa  53.5  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  32.91 
 
 		 2784 aa  53.5  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  26.92 
 
 		 652 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  34.44 
 
 		 337 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  32.9 
 
 		 3229 aa  53.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  28.48 
 
 		 709 aa  52.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  34.04 
 
 		 1883 aa  52.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.69 
 
 		 3193 aa  52.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  25.18 
 
 		 940 aa  52.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  27.97 
 
 		 1421 aa  52.4  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  26.99 
 
 		 395 aa  52.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1698  hypothetical protein  42.35 
 
 		 1046 aa  52  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.814773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  32.21 
 
 		 2377 aa  52  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  35.85 
 
 		 7284 aa  51.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  26.63 
 
 		 8871 aa  51.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  27.08 
 
 		 448 aa  50.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  31.1 
 
 		 2001 aa  51.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  29.15 
 
 		 3758 aa  50.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  36.43 
 
 		 5020 aa  50.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  34.06 
 
 		 3182 aa  50.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  33.33 
 
 		 2132 aa  50.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  29.81 
 
 		 4854 aa  49.7  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  33.81 
 
 		 3066 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4920  NHL repeat containing protein  25 
 
 		 542 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.09 
 
 		 1063 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.04 
 
 		 553 aa  49.3  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4246  NHL repeat-containing protein  24.14 
 
 		 542 aa  48.9  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359028  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.68 
 
 		 2239 aa  48.9  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  36.81 
 
 		 2567 aa  49.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.59 
 
 		 14916 aa  48.5  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  38.68 
 
 		 1631 aa  48.5  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5058  hypothetical protein  29.76 
 
 		 927 aa  48.5  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.530291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.33 
 
 		 850 aa  47.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  33.78 
 
 		 3259 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  40 
 
 		 2807 aa  47.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  28.98 
 
 		 1206 aa  46.6  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  27.97 
 
 		 621 aa  47  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  29.86 
 
 		 3508 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  34.21 
 
 		 4285 aa  46.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  29.53 
 
 		 448 aa  46.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.38 
 
 		 1415 aa  45.8  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  45.45 
 
 		 772 aa  45.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  27.73 
 
 		 1757 aa  45.4  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.72 
 
 		 1553 aa  45.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  29.93 
 
 		 503 aa  45.4  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  32.65 
 
 		 2079 aa  45.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  35.61 
 
 		 2542 aa  45.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  36.17 
 
 		 1838 aa  45.1  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.94 
 
 		 2067 aa  45.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  24.48 
 
 		 4334 aa  45.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.67 
 
 		 1180 aa  45.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.17 
 
 		 2812 aa  45.1  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36 
 
 		 1949 aa  44.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>