86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02276 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  100 
 
 		 6276 aa  12320    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  29.87 
 
 		 545 aa  149  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  33.14 
 
 		 8871 aa  146  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  38.27 
 
 		 492 aa  117  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  43.51 
 
 		 16311 aa  100  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  27.08 
 
 		 1764 aa  100  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  29.93 
 
 		 991 aa  87.8  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.08 
 
 		 3197 aa  83.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  32.9 
 
 		 3927 aa  77  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  28.67 
 
 		 998 aa  74.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  36.36 
 
 		 6678 aa  74.7  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  28.06 
 
 		 2169 aa  72  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  35.87 
 
 		 3066 aa  71.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  32.58 
 
 		 1565 aa  70.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.12 
 
 		 3699 aa  69.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  35.26 
 
 		 2715 aa  68.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.76 
 
 		 3197 aa  67.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  31.61 
 
 		 1757 aa  67.4  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  30.77 
 
 		 2377 aa  66.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5708  peptidase domain protein  30.06 
 
 		 492 aa  64.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  29.18 
 
 		 682 aa  62.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  26.7 
 
 		 2001 aa  61.6  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  24.45 
 
 		 679 aa  61.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.58 
 
 		 3323 aa  58.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  24.43 
 
 		 1094 aa  58.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  25.38 
 
 		 735 aa  58.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  21.77 
 
 		 1814 aa  58.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1512 aa  57.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  25.18 
 
 		 1842 aa  57  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  24.82 
 
 		 2036 aa  57  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  28.76 
 
 		 734 aa  57  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  27.95 
 
 		 1916 aa  55.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1682 aa  56.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  27.51 
 
 		 910 aa  55.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  23.79 
 
 		 752 aa  56.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1126 aa  55.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1416 aa  55.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  24.33 
 
 		 3699 aa  55.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  23.94 
 
 		 713 aa  55.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  22.01 
 
 		 1602 aa  55.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.94 
 
 		 1266 aa  55.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  22.43 
 
 		 1862 aa  54.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  23.05 
 
 		 669 aa  54.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  36.96 
 
 		 2132 aa  53.9  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  23.27 
 
 		 2272 aa  53.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5044  hypothetical protein  26.95 
 
 		 769 aa  53.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1927  hypothetical protein  29.65 
 
 		 2748 aa  52.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4802  hypothetical protein  30.1 
 
 		 409 aa  52.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28 
 
 		 684 aa  53.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  30.3 
 
 		 1969 aa  53.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  24.89 
 
 		 1882 aa  52.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  31.94 
 
 		 2000 aa  52.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  25.16 
 
 		 1528 aa  52.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  29.69 
 
 		 1150 aa  52.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.38 
 
 		 11716 aa  52  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  23.7 
 
 		 1620 aa  52  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  23.54 
 
 		 1361 aa  52  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  24.91 
 
 		 658 aa  51.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  23.03 
 
 		 1779 aa  51.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  20.78 
 
 		 2176 aa  51.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  25.27 
 
 		 1356 aa  50.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  26.64 
 
 		 16322 aa  50.8  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1263 aa  50.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  44.74 
 
 		 2816 aa  50.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  30.88 
 
 		 5094 aa  50.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  31.41 
 
 		 1838 aa  50.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  24.78 
 
 		 791 aa  50.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  26.35 
 
 		 554 aa  49.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  29.63 
 
 		 3758 aa  49.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  31.93 
 
 		 2522 aa  49.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  23.15 
 
 		 685 aa  49.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  25.67 
 
 		 5453 aa  49.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  28.57 
 
 		 873 aa  49.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  25.52 
 
 		 941 aa  49.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  22.49 
 
 		 551 aa  48.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  31.17 
 
 		 5745 aa  48.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2477  PKD domain containing protein  26.22 
 
 		 393 aa  48.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.041582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  27.15 
 
 		 589 aa  48.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  31.07 
 
 		 4978 aa  48.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  25 
 
 		 1300 aa  48.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  24.89 
 
 		 581 aa  47.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  22.59 
 
 		 1606 aa  47.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  36.76 
 
 		 2031 aa  47.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  23.7 
 
 		 575 aa  47.8  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  31.1 
 
 		 3544 aa  47.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  31.97 
 
 		 3222 aa  47.4  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>