59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4419 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  100 
 
 		 922 aa  1848    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  70.47 
 
 		 9867 aa  1059    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  90.91 
 
 		 912 aa  188  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  53.38 
 
 		 3193 aa  156  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  44.12 
 
 		 938 aa  151  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  44.52 
 
 		 940 aa  142  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.98 
 
 		 3427 aa  135  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  43.95 
 
 		 337 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  43.2 
 
 		 1019 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  29.28 
 
 		 4465 aa  123  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  31.55 
 
 		 3132 aa  115  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  39.47 
 
 		 1838 aa  109  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  38.78 
 
 		 3714 aa  109  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  40.82 
 
 		 2461 aa  108  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  40.69 
 
 		 2132 aa  106  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  37.58 
 
 		 8871 aa  104  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  36.53 
 
 		 8980 aa  103  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  43.06 
 
 		 2001 aa  103  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  36.36 
 
 		 16311 aa  102  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.34 
 
 		 3363 aa  102  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  38.93 
 
 		 2820 aa  101  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  31.33 
 
 		 813 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.34 
 
 		 3391 aa  99.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  38.26 
 
 		 2853 aa  99  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  38.56 
 
 		 6678 aa  99  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  34.36 
 
 		 2133 aa  95.9  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  32.65 
 
 		 1022 aa  95.5  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  32.65 
 
 		 1017 aa  95.1  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  32.89 
 
 		 917 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  36.18 
 
 		 3954 aa  94  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  35.62 
 
 		 3066 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  32.34 
 
 		 3089 aa  91.3  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  33.78 
 
 		 2802 aa  90.9  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.59 
 
 		 14916 aa  90.1  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  36.11 
 
 		 12741 aa  89  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 		 4334 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  25.78 
 
 		 7284 aa  83.2  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  35.1 
 
 		 1855 aa  83.2  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  31.13 
 
 		 3508 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  51.3 
 
 		 5218 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  37.58 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.46 
 
 		 5962 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  30.71 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  44.64 
 
 		 2377 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  44.35 
 
 		 3927 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  42.02 
 
 		 5769 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  28.57 
 
 		 824 aa  65.1  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  27.95 
 
 		 2924 aa  62  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  30.91 
 
 		 2555 aa  60.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  41.96 
 
 		 1143 aa  56.2  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  25.32 
 
 		 4120 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.44 
 
 		 11716 aa  53.5  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  38.89 
 
 		 1434 aa  52.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  24.44 
 
 		 2024 aa  50.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  25.18 
 
 		 3834 aa  49.7  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33.15 
 
 		 3477 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.46 
 
 		 2678 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.53 
 
 		 3396 aa  45.4  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  32.06 
 
 		 3094 aa  45.8  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>