105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0482 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  100 
 
 		 2132 aa  4071    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  60.57 
 
 		 2001 aa  1477    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  54.01 
 
 		 2853 aa  390  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  52.78 
 
 		 2820 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  45.96 
 
 		 3391 aa  221  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  52.73 
 
 		 4231 aa  217  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  51.71 
 
 		 3598 aa  201  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.27 
 
 		 11716 aa  189  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  50.86 
 
 		 8871 aa  173  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  43.54 
 
 		 2954 aa  167  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  46.11 
 
 		 4465 aa  166  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  35.8 
 
 		 3066 aa  155  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  28.67 
 
 		 16311 aa  153  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  38.58 
 
 		 3132 aa  150  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  44.2 
 
 		 1055 aa  142  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  44.64 
 
 		 2701 aa  139  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  45.89 
 
 		 2133 aa  137  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  30.17 
 
 		 5769 aa  135  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  47.92 
 
 		 2461 aa  132  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.4 
 
 		 14916 aa  132  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  47.59 
 
 		 3954 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  42.79 
 
 		 3544 aa  127  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  43.71 
 
 		 8980 aa  127  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  37.05 
 
 		 6678 aa  127  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  44.9 
 
 		 1838 aa  124  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  32.89 
 
 		 12741 aa  124  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  41.55 
 
 		 3699 aa  121  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.38 
 
 		 3699 aa  120  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  31.86 
 
 		 1757 aa  120  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  39.08 
 
 		 2153 aa  119  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  35.94 
 
 		 1019 aa  119  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  42.86 
 
 		 5020 aa  118  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.3 
 
 		 3363 aa  118  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  40.78 
 
 		 2522 aa  116  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  46.49 
 
 		 991 aa  114  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  42.04 
 
 		 1855 aa  114  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  37.16 
 
 		 2802 aa  110  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  36.04 
 
 		 938 aa  109  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  43.75 
 
 		 4334 aa  108  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  37.7 
 
 		 2807 aa  108  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  35.43 
 
 		 998 aa  108  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  33.48 
 
 		 3508 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  36.99 
 
 		 337 aa  107  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  40.69 
 
 		 922 aa  106  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  38.78 
 
 		 940 aa  106  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  39.22 
 
 		 2060 aa  102  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.22 
 
 		 2678 aa  102  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.3 
 
 		 3427 aa  102  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  34.72 
 
 		 426 aa  97.1  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  42 
 
 		 3209 aa  96.7  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.06 
 
 		 3089 aa  96.7  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  46.9 
 
 		 1728 aa  95.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  46.85 
 
 		 2337 aa  92.8  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  41.86 
 
 		 3477 aa  92  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  34.48 
 
 		 824 aa  92  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  35.46 
 
 		 9867 aa  91.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  33.46 
 
 		 3474 aa  89  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  34.71 
 
 		 917 aa  86.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  34.68 
 
 		 2145 aa  86.3  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  34.34 
 
 		 3714 aa  85.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  37.25 
 
 		 731 aa  85.5  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  30.47 
 
 		 962 aa  84  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  37.01 
 
 		 3230 aa  82.8  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  37.8 
 
 		 3193 aa  80.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  38.59 
 
 		 2567 aa  81.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  40.94 
 
 		 492 aa  80.5  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  35.02 
 
 		 2233 aa  80.1  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  40.74 
 
 		 3222 aa  80.1  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  28.88 
 
 		 5094 aa  79.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  43.24 
 
 		 3026 aa  79.3  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  32.34 
 
 		 2476 aa  79.3  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  45.92 
 
 		 1610 aa  78.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  32.21 
 
 		 1022 aa  77.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  32.21 
 
 		 1017 aa  77.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  36.96 
 
 		 2839 aa  76.3  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  45.1 
 
 		 1610 aa  75.9  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  34.69 
 
 		 2503 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  30.56 
 
 		 2127 aa  71.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  32.87 
 
 		 2024 aa  70.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  29.93 
 
 		 4120 aa  70.1  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  32.86 
 
 		 2402 aa  66.2  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  34.92 
 
 		 1342 aa  66.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  30.82 
 
 		 813 aa  63.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  27.81 
 
 		 3834 aa  61.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  27.89 
 
 		 7284 aa  60.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  39.33 
 
 		 2182 aa  60.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  37.21 
 
 		 2079 aa  60.1  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 		 5218 aa  58.9  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  30 
 
 		 1081 aa  58.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  38.58 
 
 		 1428 aa  57  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.8 
 
 		 3977 aa  55.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  30.27 
 
 		 6276 aa  55.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  31.44 
 
 		 1323 aa  54.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_50000  polarity establishment/cellular polarization  29.41 
 
 		 893 aa  54.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.457642 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  32.41 
 
 		 2506 aa  54.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0296  Ig family protein  30.65 
 
 		 1699 aa  53.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  30.84 
 
 		 6211 aa  53.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  37.18 
 
 		 2852 aa  52.8  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  33.17 
 
 		 1143 aa  52.4  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14743  predicted protein  32.87 
 
 		 1900 aa  51.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0619314 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>