24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50000 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_50000  polarity establishment/cellular polarization  100 
 
 		 893 aa  1813    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.457642 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01359  transmembrane glycoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09270)  31.58 
 
 		 926 aa  174  7.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02700  conserved hypothetical protein  26.15 
 
 		 1070 aa  106  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0260251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  25.41 
 
 		 4231 aa  80.9  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.48 
 
 		 11716 aa  79  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  25.47 
 
 		 2001 aa  68.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  23.99 
 
 		 2820 aa  60.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  27.78 
 
 		 4465 aa  58.9  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  24.75 
 
 		 3598 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  23.25 
 
 		 2853 aa  56.2  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  32.91 
 
 		 5020 aa  53.9  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  29.52 
 
 		 2132 aa  54.3  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  29.53 
 
 		 2954 aa  52.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  35.8 
 
 		 3544 aa  51.2  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  32.26 
 
 		 2522 aa  48.9  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  29.55 
 
 		 3222 aa  48.5  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.48 
 
 		 3699 aa  48.5  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  38.46 
 
 		 2476 aa  48.1  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  31.93 
 
 		 3699 aa  48.1  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  36.99 
 
 		 1055 aa  48.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  28.06 
 
 		 2701 aa  46.6  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  35.71 
 
 		 3209 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  36.25 
 
 		 731 aa  46.2  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  37.04 
 
 		 2503 aa  45.8  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>