172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4149 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  30.56 
 
 		 3758 aa  679    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  100 
 
 		 5020 aa  10020    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  35.24 
 
 		 4854 aa  997    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  31.39 
 
 		 4661 aa  813    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  34.65 
 
 		 4285 aa  872    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  38.58 
 
 		 2567 aa  773    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  33.24 
 
 		 3439 aa  966    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.23 
 
 		 2812 aa  997    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  33.52 
 
 		 5094 aa  603  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  30.43 
 
 		 3229 aa  570  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  28.34 
 
 		 3259 aa  432  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  32.85 
 
 		 2743 aa  415  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  26.54 
 
 		 8321 aa  384  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  34.52 
 
 		 2127 aa  375  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  34.08 
 
 		 1883 aa  362  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  28.77 
 
 		 16311 aa  356  7e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  25.65 
 
 		 2784 aa  344  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.68 
 
 		 8871 aa  333  8e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.35 
 
 		 2067 aa  305  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  25.26 
 
 		 3182 aa  280  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.11 
 
 		 5745 aa  273  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  29.03 
 
 		 6678 aa  273  5.9999999999999995e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.77 
 
 		 2239 aa  263  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  31.96 
 
 		 1206 aa  245  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.76 
 
 		 4836 aa  240  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.46 
 
 		 14916 aa  236  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  27.08 
 
 		 4231 aa  226  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  31.81 
 
 		 1141 aa  220  7e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.48 
 
 		 3699 aa  217  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.39 
 
 		 1553 aa  215  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.1 
 
 		 1884 aa  215  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  26.58 
 
 		 3699 aa  213  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  27.95 
 
 		 3508 aa  209  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  25.9 
 
 		 3544 aa  204  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  26.67 
 
 		 3927 aa  201  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.39 
 
 		 1963 aa  200  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  28.29 
 
 		 2853 aa  198  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  26.7 
 
 		 3714 aa  195  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  24.89 
 
 		 4978 aa  186  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  26.76 
 
 		 3191 aa  183  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  28.84 
 
 		 2820 aa  178  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  32.5 
 
 		 3598 aa  177  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  28.37 
 
 		 1597 aa  166  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  33.52 
 
 		 2337 aa  164  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  29.32 
 
 		 2555 aa  151  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  27.21 
 
 		 3474 aa  147  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.71 
 
 		 11716 aa  147  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  26.61 
 
 		 4465 aa  145  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  32.96 
 
 		 2001 aa  138  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  31.11 
 
 		 2353 aa  135  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.58 
 
 		 1599 aa  132  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  22.14 
 
 		 3091 aa  129  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  32.83 
 
 		 3026 aa  127  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  41.47 
 
 		 2132 aa  126  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  43.15 
 
 		 5769 aa  125  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  29.99 
 
 		 7284 aa  125  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.18 
 
 		 4220 aa  124  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  36.61 
 
 		 1728 aa  120  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.56 
 
 		 4122 aa  120  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  43.17 
 
 		 2701 aa  116  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  26.42 
 
 		 2461 aa  108  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  37.08 
 
 		 2233 aa  107  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.22 
 
 		 2812 aa  104  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  25.96 
 
 		 2839 aa  102  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.07 
 
 		 2507 aa  100  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  27.74 
 
 		 1867 aa  97.4  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  25.9 
 
 		 2251 aa  96.3  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  49.07 
 
 		 1055 aa  93.6  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  43.71 
 
 		 2503 aa  92.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  24.87 
 
 		 6211 aa  91.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  39.07 
 
 		 2476 aa  91.3  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  35.89 
 
 		 2954 aa  89  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  44 
 
 		 3209 aa  87.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  24.35 
 
 		 2768 aa  84  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  47.92 
 
 		 1019 aa  84  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1287  VCBS  42.86 
 
 		 610 aa  83.6  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.535504  normal  0.448224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  41.13 
 
 		 3391 aa  82.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  31.45 
 
 		 5442 aa  81.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1350 aa  79.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  35.71 
 
 		 1598 aa  79  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  27.76 
 
 		 3132 aa  78.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  29.19 
 
 		 2060 aa  76.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  42.34 
 
 		 1610 aa  75.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.85 
 
 		 2678 aa  74.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.41 
 
 		 5839 aa  73.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  25.81 
 
 		 1779 aa  73.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.56 
 
 		 1063 aa  73.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  25.18 
 
 		 1706 aa  72.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  27.93 
 
 		 4791 aa  71.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.05 
 
 		 5098 aa  71.2  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.03 
 
 		 3816 aa  70.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  43.52 
 
 		 2182 aa  70.5  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  24.25 
 
 		 2887 aa  69.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  35.33 
 
 		 1610 aa  68.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  35.23 
 
 		 731 aa  68.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  23.39 
 
 		 4848 aa  68.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.84 
 
 		 3089 aa  68.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  29.62 
 
 		 2079 aa  68.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  50.65 
 
 		 3977 aa  67  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  26.76 
 
 		 2074 aa  66.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>