268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3739 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  53.43 
 
 		 2820 aa  1187    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  52.36 
 
 		 2853 aa  1227    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  55.25 
 
 		 4465 aa  2029    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.8 
 
 		 3699 aa  952    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 4231 aa  8096    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.6 
 
 		 11716 aa  1659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  46.05 
 
 		 3544 aa  1021    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  44.73 
 
 		 3699 aa  981    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  44.74 
 
 		 3598 aa  520  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  40.43 
 
 		 2001 aa  474  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  35.07 
 
 		 3244 aa  453  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  31.62 
 
 		 3474 aa  349  8e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  29.87 
 
 		 2402 aa  324  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  33.19 
 
 		 2079 aa  317  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  40.07 
 
 		 2522 aa  303  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  33.59 
 
 		 3927 aa  262  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  56.86 
 
 		 2701 aa  219  7e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  52.73 
 
 		 2132 aa  212  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  28.92 
 
 		 1779 aa  204  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  27.76 
 
 		 5020 aa  187  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  37.99 
 
 		 1728 aa  183  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  50.25 
 
 		 2954 aa  182  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  42.06 
 
 		 2337 aa  174  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  30.57 
 
 		 683 aa  168  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  26.45 
 
 		 2334 aa  167  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  27.98 
 
 		 2839 aa  163  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  33.03 
 
 		 2233 aa  159  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  26.02 
 
 		 3563 aa  147  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  38.46 
 
 		 2503 aa  139  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  25.29 
 
 		 8321 aa  139  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  31.37 
 
 		 1672 aa  139  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  26.4 
 
 		 4978 aa  138  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  33.55 
 
 		 2096 aa  131  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  34.06 
 
 		 2567 aa  129  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  25.16 
 
 		 8871 aa  126  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  27.58 
 
 		 4848 aa  126  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  32.67 
 
 		 2476 aa  124  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  29.27 
 
 		 16311 aa  123  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  46.51 
 
 		 3209 aa  123  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.06 
 
 		 1884 aa  120  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1948  hypothetical protein  31.21 
 
 		 713 aa  119  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  30.06 
 
 		 2656 aa  118  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  29.48 
 
 		 3191 aa  116  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  34.09 
 
 		 2127 aa  114  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  32.24 
 
 		 3542 aa  112  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  57.73 
 
 		 2182 aa  111  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  47.65 
 
 		 5769 aa  106  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  36.59 
 
 		 3026 aa  106  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  50.96 
 
 		 1055 aa  105  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1879 aa  104  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  29.08 
 
 		 962 aa  103  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  53.12 
 
 		 1019 aa  103  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  42.26 
 
 		 2060 aa  102  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.26 
 
 		 2678 aa  101  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  47.54 
 
 		 5094 aa  98.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.91 
 
 		 2507 aa  98.6  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0788  LVIVD repeat-containing protein  27.39 
 
 		 645 aa  96.7  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0658316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.52 
 
 		 994 aa  94.4  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.25 
 
 		 1673 aa  93.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  32.95 
 
 		 1867 aa  92.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  52.99 
 
 		 1202 aa  91.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  45.14 
 
 		 4854 aa  90.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  45.26 
 
 		 2377 aa  90.5  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  30.83 
 
 		 1631 aa  90.5  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  52.48 
 
 		 1610 aa  89.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.74 
 
 		 850 aa  85.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  49.07 
 
 		 1610 aa  85.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  30.78 
 
 		 1222 aa  85.1  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  34.38 
 
 		 1323 aa  85.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  27.38 
 
 		 2145 aa  84  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  45.28 
 
 		 1342 aa  82  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  30.84 
 
 		 882 aa  82.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_50000  polarity establishment/cellular polarization  25.41 
 
 		 893 aa  81.6  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.457642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  27.92 
 
 		 1301 aa  77  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.1 
 
 		 2816 aa  76.3  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1002 aa  75.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  53.52 
 
 		 3977 aa  75.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  38.71 
 
 		 1597 aa  73.9  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.52 
 
 		 761 aa  74.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  35.45 
 
 		 2506 aa  74.3  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  29.64 
 
 		 991 aa  72.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  40.83 
 
 		 2542 aa  72.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  36.18 
 
 		 666 aa  73.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  33.19 
 
 		 4723 aa  72.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  30.19 
 
 		 731 aa  72.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.53 
 
 		 757 aa  72.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  22.44 
 
 		 2344 aa  70.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  41.11 
 
 		 1141 aa  70.1  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  37.68 
 
 		 998 aa  69.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  28.7 
 
 		 1428 aa  69.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01359  transmembrane glycoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09270)  27.17 
 
 		 926 aa  69.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  27.34 
 
 		 1334 aa  69.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1512 aa  68.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  40.18 
 
 		 1712 aa  67  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  44.36 
 
 		 1389 aa  66.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  30.32 
 
 		 2636 aa  66.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1416 aa  66.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  39.83 
 
 		 1727 aa  66.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  36.08 
 
 		 892 aa  66.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  30.79 
 
 		 1421 aa  65.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>