262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3798 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  100 
 
 		 1301 aa  2556    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  31.65 
 
 		 1334 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1657 aa  344  8e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.75 
 
 		 1344 aa  337  9e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1265 aa  313  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.82 
 
 		 1686 aa  241  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.78 
 
 		 1711 aa  223  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  25.4 
 
 		 1230 aa  204  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  28.34 
 
 		 901 aa  190  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.92 
 
 		 1510 aa  188  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.08 
 
 		 1553 aa  184  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.13 
 
 		 1481 aa  183  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  32.01 
 
 		 1699 aa  182  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  21.24 
 
 		 1236 aa  176  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.83 
 
 		 1240 aa  171  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  30.5 
 
 		 1733 aa  171  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.74 
 
 		 1357 aa  163  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1355 aa  157  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.67 
 
 		 1760 aa  157  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 885 aa  157  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.92 
 
 		 1609 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.98 
 
 		 1598 aa  145  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  28 
 
 		 1073 aa  144  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.72 
 
 		 1583 aa  144  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.71 
 
 		 1256 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.54 
 
 		 1626 aa  140  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.22 
 
 		 1823 aa  139  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.22 
 
 		 1684 aa  138  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  26.91 
 
 		 1308 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.57 
 
 		 1547 aa  132  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.69 
 
 		 1599 aa  132  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.23 
 
 		 1623 aa  132  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 		 972 aa  130  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  30.07 
 
 		 1152 aa  128  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 		 1046 aa  125  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  29.04 
 
 		 1157 aa  122  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  22.44 
 
 		 1491 aa  123  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.1 
 
 		 919 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  26.77 
 
 		 1014 aa  119  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1392 aa  118  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  26.27 
 
 		 1020 aa  118  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 		 1005 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 1353 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  26.8 
 
 		 1078 aa  117  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 		 1032 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  29.98 
 
 		 1194 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 		 973 aa  114  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  24.03 
 
 		 902 aa  115  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1026 aa  113  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 969 aa  111  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1401 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 969 aa  111  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 1080 aa  108  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  27.67 
 
 		 897 aa  108  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  27.67 
 
 		 965 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.42 
 
 		 828 aa  107  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  25.67 
 
 		 1063 aa  107  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  25.86 
 
 		 1075 aa  107  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  25.86 
 
 		 1092 aa  107  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.3 
 
 		 1617 aa  106  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  25.29 
 
 		 1075 aa  104  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.13 
 
 		 943 aa  104  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.32 
 
 		 833 aa  103  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.14 
 
 		 1190 aa  103  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.13 
 
 		 865 aa  102  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  24.95 
 
 		 1102 aa  102  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 947 aa  102  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  27.15 
 
 		 1074 aa  101  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1399 aa  100  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  24.76 
 
 		 1089 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.1 
 
 		 1398 aa  99.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  24.95 
 
 		 1075 aa  98.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  20.18 
 
 		 947 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  21.58 
 
 		 1363 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  24.76 
 
 		 1089 aa  95.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  23.73 
 
 		 1124 aa  95.5  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.05 
 
 		 1607 aa  95.1  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1211 aa  94.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  24.68 
 
 		 1092 aa  94  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  24.19 
 
 		 1067 aa  91.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.49 
 
 		 932 aa  90.9  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.1 
 
 		 696 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  21.19 
 
 		 1432 aa  89.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.85 
 
 		 835 aa  89  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  25.42 
 
 		 994 aa  88.2  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  20.43 
 
 		 1163 aa  87.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  26 
 
 		 1013 aa  87.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.81 
 
 		 729 aa  86.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.11 
 
 		 1267 aa  86.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.98 
 
 		 1652 aa  85.5  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 1221 aa  85.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  21.83 
 
 		 1196 aa  85.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  21.19 
 
 		 1188 aa  84.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.68 
 
 		 1217 aa  84.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.76 
 
 		 806 aa  84  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.09 
 
 		 1523 aa  84  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.17 
 
 		 737 aa  82.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.61 
 
 		 1557 aa  82.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1117 aa  82  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.89 
 
 		 1454 aa  82  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>