174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3640 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  72.01 
 
 		 1672 aa  2235    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1673 aa  3193    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  43.33 
 
 		 1222 aa  663    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  33.36 
 
 		 1879 aa  316  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  41.67 
 
 		 1232 aa  254  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  30.37 
 
 		 3544 aa  198  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.57 
 
 		 3699 aa  192  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  29.93 
 
 		 3699 aa  179  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  31.89 
 
 		 3563 aa  162  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  36.7 
 
 		 1544 aa  156  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.46 
 
 		 692 aa  147  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  35.15 
 
 		 683 aa  145  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  26.56 
 
 		 2402 aa  137  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  51.7 
 
 		 3911 aa  120  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  58.09 
 
 		 2042 aa  119  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  35.52 
 
 		 3542 aa  113  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  30.22 
 
 		 2522 aa  108  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  27.78 
 
 		 4231 aa  105  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  29.31 
 
 		 4465 aa  102  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  53.97 
 
 		 757 aa  100  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  43.5 
 
 		 1310 aa  100  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  33.03 
 
 		 1626 aa  99.8  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  27.46 
 
 		 1779 aa  99.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.49 
 
 		 11716 aa  98.6  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1214 aa  94.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.39 
 
 		 1272 aa  94  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  31.57 
 
 		 3244 aa  93.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  60.61 
 
 		 1394 aa  93.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  35.05 
 
 		 813 aa  92.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  31.55 
 
 		 2079 aa  91.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  62.89 
 
 		 1848 aa  90.1  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.18 
 
 		 887 aa  89.4  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  44.05 
 
 		 859 aa  87.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0322  hypothetical protein  42.06 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.620183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  37.31 
 
 		 618 aa  76.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  32.39 
 
 		 1170 aa  75.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  29.5 
 
 		 2402 aa  75.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  62.79 
 
 		 1035 aa  75.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.42 
 
 		 641 aa  73.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  27.96 
 
 		 664 aa  72  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  52.63 
 
 		 891 aa  71.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  28.57 
 
 		 2503 aa  71.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  29.89 
 
 		 1012 aa  69.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  27.06 
 
 		 597 aa  68.6  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  54.55 
 
 		 1695 aa  68.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  27.06 
 
 		 597 aa  67.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  26.38 
 
 		 1066 aa  67  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  27.85 
 
 		 2476 aa  67  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  45.45 
 
 		 1148 aa  66.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  29.83 
 
 		 2636 aa  66.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  32.41 
 
 		 731 aa  66.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  29.02 
 
 		 2853 aa  65.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  28.8 
 
 		 2839 aa  63.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  32.29 
 
 		 968 aa  64.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  27.28 
 
 		 2820 aa  63.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  25.93 
 
 		 684 aa  62.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  26.8 
 
 		 1025 aa  62.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  25.68 
 
 		 684 aa  62.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  40 
 
 		 2375 aa  62.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  36.04 
 
 		 672 aa  62.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  25.7 
 
 		 763 aa  62  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2563  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  41.18 
 
 		 336 aa  61.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.29 
 
 		 878 aa  62  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  26.12 
 
 		 759 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  25.95 
 
 		 2713 aa  60.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  26.35 
 
 		 962 aa  60.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  28.49 
 
 		 607 aa  60.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  37.93 
 
 		 1123 aa  59.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  31.46 
 
 		 658 aa  59.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  43.21 
 
 		 1129 aa  59.3  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  25.64 
 
 		 3474 aa  58.9  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  26.34 
 
 		 3506 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.27 
 
 		 1489 aa  58.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  40.34 
 
 		 471 aa  58.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  30.16 
 
 		 3598 aa  58.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  24.77 
 
 		 1369 aa  58.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1002 aa  57.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  48.45 
 
 		 556 aa  57.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  28.4 
 
 		 939 aa  57.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  37.81 
 
 		 2802 aa  57  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  24.49 
 
 		 1769 aa  57.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  28.45 
 
 		 637 aa  57  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1644  putative Ig  30.69 
 
 		 311 aa  56.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  29.06 
 
 		 1055 aa  56.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.88 
 
 		 2114 aa  55.5  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.31 
 
 		 774 aa  55.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  31.61 
 
 		 1886 aa  54.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  28.68 
 
 		 1038 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  31.22 
 
 		 1597 aa  53.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  31.66 
 
 		 1035 aa  53.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0844  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  32.88 
 
 		 311 aa  54.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  51.56 
 
 		 814 aa  53.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  28.68 
 
 		 1004 aa  54.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  31.17 
 
 		 2001 aa  53.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2919  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.1 
 
 		 1876 aa  53.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.05 
 
 		 1884 aa  53.9  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  41.89 
 
 		 1030 aa  53.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  28.96 
 
 		 2816 aa  53.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0654  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  31.94 
 
 		 311 aa  53.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  23.76 
 
 		 2074 aa  52.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>