61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2052 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  100 
 
 
2506 aa  4923    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  29.26 
 
 
3222 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  28.72 
 
 
3230 aa  313  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0296  Ig family protein  29.16 
 
 
1699 aa  245  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112212  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  36.93 
 
 
1757 aa  145  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  34.08 
 
 
2001 aa  97.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  40.57 
 
 
3477 aa  95.9  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  40.85 
 
 
6678 aa  85.1  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  33.47 
 
 
3598 aa  80.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.36 
 
 
11716 aa  78.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  33.14 
 
 
2402 aa  75.9  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  30.29 
 
 
2853 aa  74.7  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  35.45 
 
 
4231 aa  73.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  33.78 
 
 
2820 aa  71.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  35.14 
 
 
2079 aa  70.5  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  31.13 
 
 
1779 aa  69.7  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  28.12 
 
 
8871 aa  68.2  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  28.92 
 
 
1771 aa  66.6  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  36.36 
 
 
1342 aa  65.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  35.25 
 
 
3244 aa  65.9  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  32.26 
 
 
16311 aa  63.5  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  23.81 
 
 
962 aa  62  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  31.58 
 
 
3563 aa  58.9  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2281  serine threonine rich antigen  35.19 
 
 
1870 aa  58.2  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  34.69 
 
 
3542 aa  58.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  31.77 
 
 
4465 aa  57.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  35.06 
 
 
1081 aa  57.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.33 
 
 
3089 aa  57.4  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.62 
 
 
3699 aa  57.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  32.27 
 
 
2522 aa  57  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  30.62 
 
 
3699 aa  56.6  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  32.14 
 
 
1672 aa  56.2  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.95 
 
 
887 aa  55.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0929  Ig family protein  40.52 
 
 
1025 aa  54.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  32.77 
 
 
5020 aa  55.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30 
 
 
692 aa  54.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  40.13 
 
 
1222 aa  53.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  32.41 
 
 
2132 aa  53.5  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  32.34 
 
 
683 aa  53.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  40 
 
 
8321 aa  52.8  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  34.22 
 
 
672 aa  51.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  30.89 
 
 
3544 aa  51.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.63 
 
 
2807 aa  51.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.76 
 
 
1673 aa  51.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  27.47 
 
 
2715 aa  50.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  32.67 
 
 
3209 aa  50.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.57 
 
 
1272 aa  50.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  25.61 
 
 
2636 aa  50.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  38.04 
 
 
622 aa  49.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  37.65 
 
 
1728 aa  49.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  28.01 
 
 
3911 aa  49.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  31.33 
 
 
3132 aa  48.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.34 
 
 
815 aa  48.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  29.22 
 
 
2839 aa  48.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  33.14 
 
 
731 aa  48.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  34.25 
 
 
1544 aa  46.6  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  27.72 
 
 
3026 aa  46.6  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  26.17 
 
 
1232 aa  46.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2678  cell wall anchor domain-containing protein  44.07 
 
 
2271 aa  46.2  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2734  cell wall anchor domain-containing protein  44.07 
 
 
2271 aa  46.2  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  28.89 
 
 
3474 aa  45.8  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>