178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6216 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 1728 aa  3427    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  43.91 
 
 		 1744 aa  920    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  52.89 
 
 		 1589 aa  737    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  54.33 
 
 		 1785 aa  772    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  82.65 
 
 		 2337 aa  2763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  51.91 
 
 		 1838 aa  721    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  52.96 
 
 		 1781 aa  860    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  48.06 
 
 		 2135 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  52.27 
 
 		 1752 aa  863    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  54.29 
 
 		 1051 aa  800    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  46.41 
 
 		 1389 aa  632  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  43.07 
 
 		 1282 aa  538  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  35.57 
 
 		 1005 aa  253  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  33.51 
 
 		 556 aa  226  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  39.66 
 
 		 3598 aa  218  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  38.52 
 
 		 3714 aa  208  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  31.86 
 
 		 509 aa  187  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  37.99 
 
 		 4231 aa  185  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  46.8 
 
 		 631 aa  176  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.78 
 
 		 11716 aa  169  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  35.71 
 
 		 3508 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  57.05 
 
 		 1009 aa  161  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  39.08 
 
 		 2001 aa  161  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  29.45 
 
 		 522 aa  160  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  43.15 
 
 		 1627 aa  155  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  38.32 
 
 		 3026 aa  149  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  34.55 
 
 		 2853 aa  147  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  29 
 
 		 565 aa  145  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  27.31 
 
 		 528 aa  140  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  30.48 
 
 		 552 aa  139  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  33.52 
 
 		 2820 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  29.34 
 
 		 542 aa  134  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  27.99 
 
 		 514 aa  134  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  45.57 
 
 		 824 aa  130  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  27.18 
 
 		 584 aa  129  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  35.26 
 
 		 4465 aa  128  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  43.59 
 
 		 642 aa  125  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  28.89 
 
 		 506 aa  122  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  40.49 
 
 		 430 aa  122  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  27.97 
 
 		 569 aa  121  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  43.71 
 
 		 523 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  29.51 
 
 		 553 aa  119  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  31.23 
 
 		 2784 aa  117  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.07 
 
 		 1066 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  32.85 
 
 		 2522 aa  112  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  36.27 
 
 		 5020 aa  109  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  28.54 
 
 		 458 aa  108  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  34.69 
 
 		 3544 aa  107  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  32.41 
 
 		 3699 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  30.6 
 
 		 5769 aa  103  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  47.62 
 
 		 2954 aa  102  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.57 
 
 		 3699 aa  101  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  48.67 
 
 		 1055 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  46.9 
 
 		 2132 aa  95.1  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  48.45 
 
 		 119 aa  94.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  33.47 
 
 		 614 aa  93.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  43.85 
 
 		 5094 aa  92  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  31.53 
 
 		 2887 aa  88.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  28.88 
 
 		 3229 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  31.36 
 
 		 3182 aa  87  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  29.29 
 
 		 6678 aa  84.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  27.99 
 
 		 559 aa  84  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.05 
 
 		 2067 aa  84.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  39.17 
 
 		 2701 aa  83.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  41.33 
 
 		 2060 aa  83.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.12 
 
 		 1553 aa  82.4  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.67 
 
 		 2678 aa  81.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  26.52 
 
 		 515 aa  81.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  44.9 
 
 		 3209 aa  80.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  28.36 
 
 		 16311 aa  81.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  41.73 
 
 		 1342 aa  81.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  31.13 
 
 		 3439 aa  79.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.85 
 
 		 1599 aa  79.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  48.45 
 
 		 1610 aa  78.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  27.67 
 
 		 547 aa  78.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  27.22 
 
 		 2461 aa  77.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  45.74 
 
 		 1019 aa  77  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  24.72 
 
 		 503 aa  77  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  34.48 
 
 		 2127 aa  75.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  31.18 
 
 		 4854 aa  73.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  32.34 
 
 		 2816 aa  72.8  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  30.36 
 
 		 1883 aa  70.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.68 
 
 		 5098 aa  70.5  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  26.57 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  44.66 
 
 		 1610 aa  69.3  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.03 
 
 		 2239 aa  68.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.16 
 
 		 3038 aa  68.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  30.29 
 
 		 2402 aa  67.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.42 
 
 		 2812 aa  67.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  31.87 
 
 		 3191 aa  67.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  31.95 
 
 		 4285 aa  67  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  29.22 
 
 		 765 aa  67.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.47 
 
 		 761 aa  67  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.41 
 
 		 2839 aa  66.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  27.23 
 
 		 1597 aa  65.9  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  41.67 
 
 		 1586 aa  65.5  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  32.9 
 
 		 2567 aa  65.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  29.56 
 
 		 2555 aa  64.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  28.19 
 
 		 4661 aa  63.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  30.47 
 
 		 1215 aa  63.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>