51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2197 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  100 
 
 		 614 aa  1233    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  35.1 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  36.6 
 
 		 628 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  36.32 
 
 		 448 aa  198  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  34.45 
 
 		 515 aa  150  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  30.6 
 
 		 559 aa  145  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  31.2 
 
 		 556 aa  141  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  35.91 
 
 		 547 aa  140  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  32.29 
 
 		 1005 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  31.27 
 
 		 506 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  30.05 
 
 		 522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  31.93 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1051 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  30.08 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  28.61 
 
 		 569 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  29.37 
 
 		 514 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  31.97 
 
 		 546 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  31.35 
 
 		 528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1785 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  35.32 
 
 		 1781 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  29.71 
 
 		 584 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  31.46 
 
 		 509 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  35.04 
 
 		 1752 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  34.68 
 
 		 1838 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1744 aa  99  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1589 aa  97.4  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  32.67 
 
 		 1728 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  31.58 
 
 		 2337 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  30.07 
 
 		 552 aa  91.7  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  32.18 
 
 		 2135 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  30.32 
 
 		 565 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  32.22 
 
 		 541 aa  87.4  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  33.01 
 
 		 1389 aa  87.4  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1627 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1282 aa  84.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  24.43 
 
 		 670 aa  70.5  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  27.15 
 
 		 757 aa  67  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  25.97 
 
 		 553 aa  66.6  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  28.14 
 
 		 691 aa  61.2  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  23.99 
 
 		 717 aa  55.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  25.84 
 
 		 705 aa  55.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  22.92 
 
 		 777 aa  53.5  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  22.99 
 
 		 753 aa  53.5  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  26.79 
 
 		 772 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  22.12 
 
 		 765 aa  52  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  24.68 
 
 		 810 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  24.5 
 
 		 810 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  27.74 
 
 		 757 aa  51.6  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  30.77 
 
 		 773 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  25.3 
 
 		 765 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  24.42 
 
 		 753 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>