45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5002 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  100 
 
 
670 aa  1377    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  33.39 
 
 
717 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  30.56 
 
 
691 aa  262  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  34.17 
 
 
773 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  30.38 
 
 
705 aa  249  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  31.33 
 
 
777 aa  240  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  32.99 
 
 
772 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  36.78 
 
 
753 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  32.84 
 
 
757 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  31.71 
 
 
753 aa  224  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  34.38 
 
 
765 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  29.95 
 
 
757 aa  213  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  32.63 
 
 
765 aa  210  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  30.69 
 
 
810 aa  177  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  29.83 
 
 
810 aa  173  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  24.95 
 
 
514 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  33.68 
 
 
541 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  24.43 
 
 
614 aa  74.7  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  24.54 
 
 
522 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  25.31 
 
 
503 aa  68.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  24.03 
 
 
506 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  22.53 
 
 
1785 aa  64.3  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  23.94 
 
 
556 aa  63.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  23.31 
 
 
1589 aa  61.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  25.2 
 
 
458 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  23.26 
 
 
1781 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  25.44 
 
 
509 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  21.51 
 
 
1838 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  24.05 
 
 
528 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  25.62 
 
 
542 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  24.03 
 
 
448 aa  54.7  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  22.97 
 
 
2337 aa  54.3  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  22.72 
 
 
1728 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  22.9 
 
 
1752 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  25.88 
 
 
584 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  24.42 
 
 
559 aa  50.8  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  24.01 
 
 
569 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  24.46 
 
 
552 aa  50.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  22.41 
 
 
1389 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  23.14 
 
 
1051 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  21.09 
 
 
1005 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  26.4 
 
 
515 aa  48.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  26.12 
 
 
546 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  36 
 
 
547 aa  45.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  24.08 
 
 
628 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>